Różnica między Transposon i Retrotransposon

Transposon vs Retrotransposon

Transpozony i retrotranspozony są genetycznymi składnikami DNA i istnieją między nimi znaczne różnice. Procentowa obecność tych materiałów genetycznych jest różna u różnych gatunków, a ich funkcje determinują losy organizmu z mutacjami i innymi fenotypowo ważnymi zmianami. Transpozony i retrotranspozony to geny lub zbiory niektórych genów zlokalizowanych w niciach DNA, a zmiany ich lokalizacji były głównymi przyczynami tych konsekwencji. Jednak w tym artykule krótko omówiono funkcje tych genów i przedstawiono porównanie transpozonów i retrotranspozonów.

Co to jest Transposon?

Transpozony są interesującymi fragmentami lub segmentami DNA z możliwością zmiany lokalizacji nici DNA w formie mechanizmu wycinania i wklejania. Z powodu tej mobilnej natury transpozonów są one znane jako skaczące geny. Transpozony należą do dwóch głównych typów, znanych jako transpozony klasy I i transpozony klasy II. Zazwyczaj typ klasy II jest nazywany transpozonem, a typ klasy I jest nazywany retrotranspozonem. Procesy cięcia i wklejania ruchomych segmentów DNA są regulowane przez enzym transpozazę. Enzym wiąże się z obydwoma końcami transpozonu i tnie wiązania fosfodiestrowe nici DNA, izoluje transpozon, przenosi go do miejsca docelowego i wiąże w nowej lokalizacji. Jednak ten proces jest interesujący do zrozumienia, ponieważ niektóre transpozony mogą przemieszczać się tylko do niektórych lokalizacji tylko z powodu niezgodności sekwencji zasad z miejscem docelowym. Geny z jednym końcem pojedynczej nici mają tę samą sekwencję zasad, a drugi koniec drugiej pojedynczej nici są transpozonami z lepkimi krawędziami, ponieważ mogą one wiązać się z miejscami docelowej nici DNA o tej samej sekwencji zasad, co w lepkich końcach . Jednak ta ruchliwość genów może powodować zmiany genotypu, a także fenotypu organizmu. Następnie naukowcy wymyślili transpozony oraz genetycznie zmodyfikowaną żywność i organizmy zgodnie z preferowanymi dostosowaniami. Wysoce produktywne uprawy rolnicze, antybiotyki o właściwościach leczniczych, zwierzęta hodowlane były jednymi z najlepiej opracowanych produktów po wynalezieniu transpozonów przez Barbarę McClintock w latach 40..

Co to jest Retrotransposon?

Retrotranspozony są transpozonami klasy I, które przemieszczają się przez genom poprzez mechanizm kopiowania i wklejania. Mechanizm ruchliwości retrotranspozonów obejmuje kilka głównych etapów, takich jak kopiowanie segmentu genowego nici DNA do RNA, przeniesienie kopii RNA do miejsca docelowego, transkrypcja sekwencji RNA z powrotem do DNA przy użyciu odwrotnej transkryptazy i insercja genu do nowej lokalizacji nici DNA genomu. Dwa końce tych retrotranspozonów mają zwykle długie końcowe powtórzenia z około 1000 parami zasad, które są wykorzystywane jako cechy identyfikacyjne tych genów. Geny te są łatwo amplifikowane w genomie, a odsetek retrotranspozonów w ludzkim genomie wynosi około 50%. Mogą być one dość niebezpieczne, ponieważ wirus wywołujący AIDS, HIV i wirus białaczki komórek T ma retrotranspozony w genomach RNA. W rzeczywistości wirusy te mogą wiązać retrotranspozony z dowolnym miejscem ludzkich nici DNA za pomocą odwrotnej transkryptazy i integrazy. Enzym integraza działa tak samo jak transpozaza w transpozonach klasy II.