Różnica między agarozą a poliakryloamidem

Agaroza vs poliakryloamid

Istnieją różne różnice dotyczące agarozy i poliakryloamidu, w tym ich budowa fizyczna, toksyczność i metody nalewania, a także ich cena. Dobrze jest znać te różnice, a także ich podobieństwa, jeśli masz do czynienia z jednym z tych rodzajów żeli.

Jedną z głównych różnic między tymi dwoma żelami jest to, że agarozę wlewa się poziomo, a poliakryloamid wlewa się pionowo. O wiele łatwiej jest wlewać agarozę w ten poziomy sposób. Agarozę można ogrzewać w celu ułatwienia procesu wlewania, chociaż nie należy jej podgrzewać w takim stopniu, aby agaroza się stopiła. Można również zdecydować, czy do wlania agarozy użyć wąskich czy szerokich pasów. Można go wylać za pomocą tej metody rowkowania i jest to jedna z jego zalet. Podczas nalewania należy zachować szczególną ostrożność, ponieważ agaroza jest bardzo delikatna i może łatwo pękać.

Z drugiej strony, jak wspomniano, poliakryloamid wylewa się pionowo. Poliakryloamid potrzebuje szklanych płyt, aby pomóc w tym procesie, ponieważ jego struktura jest bardzo cienka, a to dodatkowe wsparcie jest konieczne. W przeciwieństwie do agarozy, poliakryloamidu nie można ponownie ogrzać, a następnie wlać.

Agaroza składa się z wielu cząsteczek, podczas gdy poliakryloamid zwykle składa się tylko z jednej dużej cząsteczki. Cząsteczki agarozy są utrzymywane razem przez siły międzycząsteczkowe, a cząsteczki składają się z DNA. Istnieją duże i małe cząsteczki i ogólnie większe cząsteczki łatwiej się rozdziela niż mniejsze. Cząsteczka poliakryloamidu składa się z DNA lub białka. Przerwy między żelami poliakryloamidowymi są mniejsze niż między żelami agarozy, co stanowi kolejną różnicę między tymi dwiema substancjami. Tam, gdzie rozmiar prążków jest taki sam w agarozie, istnieją różne rozmiary prążków w poliakryloamidzie. Jeśli cząsteczka poliakryloamidu zostanie wystawiona na działanie powietrza, nie zestali się w równomierny sposób, ponieważ powietrze przyspiesza proces polimeryzacji.

Jeśli chodzi o toksyczność, agarozę uważa się za substancję nietoksyczną. Chociaż poliakryloamid jest uważany za taki sam, jego proszek jest uważany za toksyczny i rozsądnie jest nawet obchodzić się z żelami za pomocą środków ochronnych.

Poliakryloamid służy do sekwencjonowania żeli i żeli białkowych. Jego zalety polegają na tym, że ma on łatwe barwienie i można go wysuszyć w celu utworzenia żelu. Jest kupowany fabrycznie wlany i jest tańszy niż agaroza, w cenie około 5 $ 7 za żel. (Agaroza kosztuje około 1 USD za gram). Przed zakupem któregokolwiek z tych dwóch żeli zaleca się posiadanie wystarczającego doświadczenia, ponieważ często wymagana jest liczba próbek i stężenie potrzebnego żelu przed zakupem.

Streszczenie:

1.Agarozę wlewa się poziomo, a poliakryloamid wlewa się pionowo.
2.Agaroza jest droższa niż poliakryloamid.
3.Agaroza składa się z wielu cząsteczek, podczas gdy poliakryloamid składa się tylko z jednej dużej cząsteczki.
4. W przeciwieństwie do poliakryloamidu agarozę można ponownie ogrzać.
5.Agaroza jest uważana za substancję nietoksyczną we wszystkich jej postaciach, natomiast proszek poliakryloamidu jest toksyczny.