Różnica między YAC i wektorem fagowym M13

Kluczowa różnica - YAC vs M13 Phage Vector
 

Klonowanie DNA jest ważnym procesem, który umożliwia namnażanie ważnych fragmentów DNA organizmów. Wymaga połączenia specyficznego DNA z DNA wektorowym w celu stworzenia rekombinowanego DNA, który przekształca się w organizm gospodarza. Wektor jest cząsteczką DNA, która zachowuje się jak nośnik do przenoszenia obcego materiału genetycznego do innej komórki lub organizmu. Powinien być zdolny do replikacji w organizmie gospodarza i wytwarzania wielu kopii rekombinowanego DNA. Istnieją różne rodzaje wektorów używanych do klonowania DNA. Drożdżowy sztuczny chromosom (YAC) i wektor fagowy M13 to dwa spośród nich. Kluczowa różnica między wektorem fagowym YAC i M13 jest taka YAC jest sztucznym chromosomem, który replikuje się w komórkach drożdży podczas Wektor faga M13 jest jednoniciowym kolistym DNA bakteriofaga M13, który się replikuje E coli komórki.

ZAWARTOŚĆ
1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to jest YAC
3. Co to jest wektor fagowy M13
4. Porównanie obok siebie - YAC vs M13 wektor fagowy
5. Podsumowanie

Co to jest wektor YAC?

YAC jest sztucznie zbudowanym chromosomem, który ma zdolność przenoszenia dużego segmentu obcego DNA i replikacji w komórkach drożdży. Ma centromer, telomer i autonomicznie replikujące się sekwencje niezbędne do replikacji i stabilności. YAC powinien również nosić selektywny marker lub markery i miejsca restrykcyjne, aby był skutecznym wektorem do klonowania. Duże sekwencje w zakresie od 1000 kb do 2000 kb można wstawić do YAC i przenieść do drożdży.

Rysunek 01: Wektor YAC

Co to jest wektor fagowy M13?

Bakteriofag M13 jest wirusem, który infekuje i replikuje E coli. Genom bakteriofaga M13 jest niewielki, około 6,7 kb. Jest to jednoniciowy, kołowy i pozytywnie sensowny DNA. Wirus ten szczególnie infekuje E coli bakterie przez pilus F. Po wejściu do ssDNA do bakterii syntetyzuje swoją komplementarną nić i staje się dsDNA lub formą replikacyjną (RF) M13. RF może zachowywać się jak plazmid w organizmie gospodarza. DsDNA replikuje się w obrębie E coli i produkuje ssDNA z nowymi fagami. Te nowe fagi są stale uwalniane z E coli bez zabijania komórki gospodarza. Jednak infekcja spowalnia wzrost E. Coli. dsDNA można ekstrahować z komórek bakteryjnych i stosować jako wektory w klonowaniu DNA. Są one znane jako wektory fagowe M13. Można nimi łatwo manipulować i stosować je podobnie jak wektory plazmidowe.

Wrodzona zdolność infekcji tych fagów M13 służy jako dobra kwalifikacja do zastosowania jako wektor w klonowaniu genów. Podczas rozwijania M13 w wektor, kilka elementów powinno zostać włączonych do jego genomu. Są genem białka represora lac (lac I), regionu proksymalnego operatora Lac Z gen, promotor lac i miejsce wielokrotnego klonowania (polilinker). Gdy dsDNA z M13 stosuje się jako wektory, można go traktować jako wektor plazmidowy. Jednak zastosowanie ssDNA M13 ma zalety w sekwencjonowaniu DNA i mutagenezie ukierunkowanej.

Ponieważ wektor faga M13 zawiera wiele miejsc klonowania w LacZ region, rekombinowane wektory można łatwo zidentyfikować przez przeszukiwanie niebiesko-białej kolonii na płytkach agarowych zawierających IPTG i X-Gal. Niebieskie płytki wytworzone na płytkach nie zawierają rekombinowanych fagów. Dlatego fagi z wstawkami można wybrać do celów klonowania.

Rycina 02: Bakteriofag M13

Jaka jest różnica między YAC a wektorem fagowym M13?

YAC vs M13 Phage Vector
YAC to genetycznie zmodyfikowany chromosom, który ma zdolność przenoszenia dużego segmentu obcego DNA i replikacji w komórkach drożdży.	Wektor faga M13 jest wektorem wirusowym opracowanym przez bakteriofaga M13, który służy do wstawiania obcego DNA E coli.
Cel, powód
YAC zaprojektowano do klonowania dużych fragmentów genomowego DNA w drożdżach.	Wektory fagowe M13 są stosowane do wstawiania obcego DNA do E coli.
Wstaw długość
YAC mogą zawierać wstawki genomowe wielkości megabazy (1000 kb - 2000 kb).	Rozmiar wkładek wynosi około 1500 bps.
Budowa
DNA YAC jest trudne do oczyszczenia w stanie nienaruszonym i wymaga wysokiego stężenia do generowania układu wektorowego YAC.	Występuje poprzez cykliczny fotosyntetyczny łańcuch elektronów.
Stabilność
YAC jest niestabilny.	Fagi M13 można łatwo wyodrębnić.
Rozmiar
Enzymy to większe cząsteczki.	Fagi M13 są stabilne niż YAC.

Podsumowanie - YAC vs M13 Phage Vector

YAC jest sztucznie skonstruowanym systemem wektorowym wykorzystującym określony region chromosomu drożdży do wstawiania dużych segmentów materiału genetycznego do komórek drożdży. Wektor faga M13 jest systemem wektorowym pochodzącym z bakteriofaga M 13, który wykorzystuje E coli jako organizm gospodarza. Jest to główna różnica między YAC i M13 Phage Vector. Oba są równie przydatne w technologii rekombinacji DNA i klonowaniu genów.

Odniesienie:
1. „Vector”. Notatki genetyczne - wektor. N.p., n.d. Sieć. 16 maja 2017 r. Https://genetics-notes.wikispaces.com/Vector
2. „Sztuczny chromosom drożdży”. Wikipedia. Fundacja Wikimedia, 21 kwietnia 2017 r. Internet. 16 maja 2017 r. .

Zdjęcie dzięki uprzejmości:
1. „M13B” Autor: J3D3 - Praca własna (CC BY-SA 3.0) przez Commons Wikimedia