Różnica między wektorami YAC i BAC

Kluczowa różnica - wektory YAC vs. BAC
 

Wektory stosuje się w klonowaniu molekularnym. Wektor można zdefiniować jako cząsteczkę DNA, która zachowuje się jak nośnik do przenoszenia obcego materiału genetycznego do innej komórki. Wektor zawierający obcy DNA jest znany jako rekombinowany DNA i powinien mieć zdolność do replikacji i ekspresji w organizmie gospodarza. Drożdżowy sztuczny chromosom (YAC) i sztuczny chromosom bakteryjny (BAC) to dwa typy wektorów zaangażowanych w klonowanie. Kluczowa różnica między YAC i BAC jest taka YAC to sztucznie skonstruowany system wektorowy wykorzystujący określony region chromosomu drożdży do wstawiania dużych segmentów materiałów genetycznych do komórek drożdży podczas BAC jest sztucznie skonstruowanym systemem wektorowym wykorzystującym określony region E coli chromosom do wstawienia dużych segmentów DNA E coli komórki.

ZAWARTOŚĆ
1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to są wektory YAC
3. Co to są wektory BAC
4. Porównanie obok siebie - Wektory YAC vs BAC
5. Podsumowanie

Co to są wektory YAC?

YAC (sztuczny chromosom drożdży) to sztucznie zbudowany chromosom, który ma zdolność przenoszenia dużego segmentu obcego DNA i replikacji w komórkach drożdży. Ma centromer, telomery, a także autonomicznie replikujące się sekwencje, które są niezbędne do replikacji i stabilności. YAC powinien również nosić selektywny marker lub markery i miejsca restrykcyjne, aby był skutecznym wektorem do klonowania. Duża sekwencja od 1000 kb do 2000 kb może być wstawiona do YAC i przeniesiona do drożdży. Wydajność transformacji YAC jest bardzo niska.

Rysunek 01: Wektor YAC

Co to są wektory BAC?

Bakteryjny sztuczny chromosom (BAC) to sztucznie skonstruowany chromosom do klonowania molekularnego. Ma określone regiony E coli Plazmid F i jest okrągły i super zwinięty. BAC został opracowany w celu klonowania fragmentów DNA do bakterii, szczególnie do E coli. Może zawierać fragmenty DNA o wielkości do 300 kb. W porównaniu do YAC wkładki klonujące BAC są mniejsze. BAC zostały opracowane w 1992 roku i nadal są popularne ze względu na stabilność i łatwość konstrukcji. BAC są również przydatne w opracowywaniu szczepionek.

Rycina 02: Wektor BAC w klonowaniu molekularnym

Jaka jest różnica między wektorami YAC i BAC?

Wektory YAC vs BAC
YAC jest genetycznie zmodyfikowanym chromosomem wykorzystującym DNA drożdży do klonowania.	BAC to genetycznie zmodyfikowana cząsteczka DNA wykorzystująca E coli DNA w celu klonowania.
Płeć
YAC zaprojektowano do klonowania dużych fragmentów genomowego DNA w drożdżach.	Opracowano BAC do klonowania dużych fragmentów genomowych do Escherichia coli.
Wstaw długość
YAC mogą zawierać wstawki genomowe wielkości megabazy. (1000 kb - 2000 kb).	BAC mogą przenosić wkładki o wielkości 200–300 kb lub mniejszej.
Budowa
DNA YAC jest trudne do oczyszczenia w stanie nienaruszonym i wymaga wysokiego stężenia do generowania układu wektorowego YAC.	BAC jest łatwy do czyszczenia w stanie nienaruszonym i można go łatwo zbudować.
Chimeryzm
YAC są często chimeryczne.	BAC są rzadko chimeryczne.
Stabilność
YAC jest niestabilny.	BAC jest stabilny.
Modyfikacje
Rekombinacja drożdży jest bardzo możliwa i zawsze pozostaje aktywna. W związku z tym może generować usunięcia i inne zmiany w YAC.	E coli rekombinacja jest uniemożliwiona i jest włączana w razie potrzeby. W ten sposób zmniejsza niechciane zmiany w BAC.
Konserwacja
Manipulowanie rekombinowanymi YAC zwykle wymaga przeniesienia YAC E coli do późniejszej manipulacji. Dlatego jest to pracochłonny proces.	Modyfikacja BAC następuje bezpośrednio w E coli. Więc nie ma potrzeby transferu DNA. Dlatego proces nie jest pracochłonny.

Podsumowanie - Wektory YAC vs BAC

YAC stał się niezbędnym narzędziem badawczym w procesach klonowania ze względu na jego zdolność do klonowania dużych fragmentów DNA do organizmu gospodarza. Jednak YAC mają kilka wad, takich jak wektory, takie jak trudności konstrukcyjne, chimeryzm, niestabilność itp. Dlatego w celu przezwyciężenia tych problemów naukowcy opracowali wektory BAC. BAC został zbudowany przy użyciu określonych regionów E coli chromosom. Jest to stabilny wektor i można go łatwo zbudować. Jednak długość DNA, którą BAC może obsłużyć, jest do 20 razy mniejsza niż długość YAC. Jest to różnica między systemami wektorowymi YAC i BAC. Obecnie BAC jest bardziej preferowany w laboratorium niż YAC.

Bibliografia
1. Shero, J. H., M. K. McCormick, S. E. Antonarakis i P. Hieter. „Drożdżowe sztuczne wektory chromosomowe do wydajnej manipulacji klonowaniem i mapowania”. Genomika National Library of Medicine, czerwiec 1991. Web. 25 marca 2017 r
2. Ramsay, M. „Drożdżowe sztuczne klonowanie chromosomów”. Biotechnologia molekularna. U.S. National Library of Medicine, kwiecień 1994. Web. 25 marca 2017 r

Zdjęcie dzięki uprzejmości:
1. „Wektory do klonowania BAC Chem114A” Autor: Tinastella - (CC BY-SA 3.0) przez Commons Wikimedia