Różnica między RNASE A i RNASE H

Kluczowa różnica - RNASE A vs RNASE H.
 

Rybonukleazy są nukleazami, które specyficznie rozkładają RNA na mniejsze jednostki. Można je podzielić na dwie kategorie; endoribonukleazy i egzoribonukleazy. Endoribonukleaza jest endonukleazą, która może albo degradować jednoniciowy, albo dwuniciowy RNA. Rozcina wiązania fosfodiestrowe w łańcuchu polinukleotydowym RNA. Przykładami są RNaza A, RNaza III, RNaza T1, RNaza P i RNaza H. Egzoribonukleaza jest egzonukleazą, która degradowała RNA poprzez usunięcie końcowych nukleotydów z końca 5 'lub 3' cząsteczki RNA. Przykładami są RNaza R, RNaza II, RNaza D i RNaza PH. The kluczowa różnica pomiędzy RNASE A i RNASE H jest to, że RNaza A jest rybonukleazą trzustkową, która specyficznie rozkłada jednoniciowy RNA na mniejsze składniki, podczas gdy RNaza H jest niespecyficznym enzymem, który rozszczepia RNA w hybrydzie RNA-DNA na mniejsze jednostki poprzez mechanizm hydrolityczny.

ZAWARTOŚĆ

1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to jest RNASE A
3. Co to jest RNASE H.
4. Podobieństwa między RNASE A i RNASE H
5. Porównanie obok siebie - RNASE A vs RNASE H w formie tabeli
6. Podsumowanie

Co to jest RNASE A?

RNaza A jest rybonukleazą trzustkową, która specyficznie rozcina niesparowane reszty cytozyny i uracylu na końcu 3 'jednoniciowego RNA. RNaza H działa przy wyższym stężeniu soli (0,3 M lub wyższym stężeniu NaCl). Reakcja hydrolityczna przebiega w dwóch etapach. Tworzy fosforylowany produkt 3 'poprzez pośredni cykliczny monofosforan 2', 3 '. Chociaż jest specyficzny dla jednoniciowego RNA przy wyższym stężeniu soli, może również degradować dwuniciowy RNA i RNA w hybrydzie RNA-DNA przy niższym stężeniu NaCl (niższym niż 0,3 M NaCl).

Bruce Merrifield najpierw zsyntetyzował ten enzym. RNaza A jest bardzo popularnym enzymem w badaniach molekularnych. Bydlęca RNaza A trzustki jest przykładem RNazy A. Jest to jeden z najtwardszych enzymów stosowanych w laboratorium. Enzym ten nie potrzebuje kofaktora do swojej aktywności. Jest to wysoce termostabilny enzym. RNaza A jest pierwszym enzymem i trzecim białkiem, dla którego wykryto prawidłową sekwencję aminokwasową. Enzym ten jest bardzo mały, ma 124 aminokwasy i masę cząsteczkową 12600da. I ma cztery reszty histydyny (His 12 i His 119, które biorą udział w reakcji katalitycznej).

Rysunek 01: RNaza A

RNazę A można wydzielić przez gotowanie surowej próbki. Podczas gotowania wszystkie inne enzymy rozkładają pozostałą RNazę A. RNaza A jest niezwykle stabilnym enzymem. Enzym ten hamuje kompleksami białka rybonukleazy, kompleksów metali ciężkich i wanadanu urydyny.

Co to jest RNase H.?

RNaza H jest niespecyficznym enzymem rybonukleazy, który może degradować RNA w hybrydzie RNA-DNA poprzez reakcję hydrolityczną. RNaza H rozcina wiązanie 3'-O-R RNA w hybrydzie RNA-DNA. Ostatecznie wytwarza 3'OH i 5 'produkty zakończone fosforanem. W replikacji DNA odgrywa kluczową rolę, usuwając starter RNA po utworzeniu nowych nici DNA. W warunkach laboratoryjnych specyficznie degraduje RNA w hybrydzie RNA-DNA, ale nie w DNA i niezhybrydyzowanym RNA. Ten enzym jest zwykle używany do niszczenia matrycy RNA po utworzeniu pierwszej komplementarnej nici DNA podczas syntezy cDNA.

Rycina 02: RNaza H

RNase H stosuje również w testach ochrony nukleaz. Można go również włączyć do usuwania ogona poli A z mRNA. RNaza H ma zdolność do niszczenia niekodującego RNA wewnątrz i na zewnątrz komórki. Jony metali są wymagane jako kofaktory tej aktywności białka. W celu zahamowania enzymu RNazy H można zastosować chelator (EDTA).

Jakie są podobieństwa między RNASE A i RNASE H.?

• Oba mają charakter białkowy.
• Oba są endoribonukleazą
• Oba mogą degradować RNA.
• Oba wykonują reakcje hydrolityczne.
• Laboratoria molekularne używają obu tych metod.

Jaka jest różnica między RNASE A i RNASE H?

RNASE A vs RNASE H.
RNaza A jest rybonukleazą trzustkową, która specyficznie odcina koniec 3 'niesparowanych reszt cytozyny i uracylu jednoniciowego RNA przy wyższym stężeniu soli.	RNaza H jest niespecyficznym enzymem rybonukleazy, który może degradować RNA w hybrydzie RNA-DNA poprzez reakcję hydrolityczną.
Natura rozszczepiania RNA
RNaza A specyficznie rozszczepia jednoniciowy RNA przy wyższym stężeniu soli.	RNaza H rozcina RNA w hybrydzie RNA-DNA.
Potrzeba współczynników dla działania
RNaza A nie potrzebuje kofaktorów do swojej aktywności.	RNaza H potrzebuje jonów metali jako kofaktorów dla swojej aktywności.
Inhibitory aktywności białek
Kompleksy inhibitora rybonukleazy, kompleksów metali ciężkich i wanadanu urydyny hamują aktywność RNAzy A..	Chelator (EDTA) hamuje aktywność RNazy H..
Usuwanie RNA Primer w replikacji DNA
RNazy A nie stosuje się do usuwania startera RNA w replikacji DNA.	RNaza H jest używana do usuwania startera RNA w replikacji DNA
Usuwanie matrycy DNA w syntezie komplementarnego DNA (C-DNA)
RNazy A nie stosuje się do usuwania matrycy RNA podczas syntezy komplementarnego DNA (C-DNA).	RNaza H jest stosowana do usuwania matrycy RNA podczas syntezy komplementarnego DNA (C-DNA).
Usunięcie poli-A-Tail w mRNA Hybridized to Oligo (dt)
RNazy A nie stosuje się do usuwania „ogona poli-A” w mRNA hybrydyzowanym z oligo (dt).	RNaza H służy do usuwania „ogona poli-A” w mRNA zhybrydyzowanego z oligo (dt)

streszczenie - RNASE A vs RNASE H.

Rybonukleazy są enzymami nukleazowymi, które mają zdolność rozszczepiania RNA na mniejsze jednostki. Są dwa typy; endoribonukleazy i egzoribonukleazy. Endoribonukleaza jest endonukleazą, która ma zdolność degradacji jednoniciowego lub dwuniciowego RNA. I rozcina wiązanie fosfodiestrowe w łańcuchu polinukleotydowym RNA. RNaza A i RNaza H to dwie endoribonukleazy. RNaza A jest rybonukleazą trzustkową, która specyficznie rozcina niesparowane reszty cytozyny i uracylu na końcu 3 'jednoniciowego RNA przy wyższym stężeniu soli. RNaza H jest niespecyficznym enzymem rybonukleazy, który może degradować RNA w hybrydzie RNA-DNA poprzez reakcję hydrolityczną. Jest to różnica między RNazą A i RNazą H.

Pobierz plik PDF RNASE A vs RNASE H.

Możesz pobrać wersję PDF tego artykułu i używać go do celów offline zgodnie z cytatem. Pobierz wersję PDF tutaj Różnica między RNASE A i RNASE H

Odniesienie:

1.Karuturi, autor Amrutha. „17 musi znać fakty na temat RNase A.” AG Blog, 22 lutego 2017 r. Dostępny tutaj
2. „Rybonukleaza”. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5 stycznia 2018 r. Dostępne tutaj  

Zdjęcie dzięki uprzejmości:

1.'RNase A'By Nie podano autora do odczytu maszynowego. Założono, że Vossman (na podstawie praw autorskich)., (CC BY-SA 2.5) przez Commons Wikimedia
2.'RNase H fix'By Nie podano autora do odczytu maszynowego. Założono, że Vossman (na podstawie praw autorskich)., (CC BY-SA 2.5) przez Commons Wikimedia