Al-Kaida i Talibów są odrębnymi grupami terrorystycznymi ekstremistycznych muzułmanów, którzy źle interpretują założenia
Al-Kaida została formalnie zorganizowana pod koniec lat 80. ubiegłego wieku przez kilku wyższych przywódców islamskich, w tym Osamę Bin Ladena, który zapewnił znaczną część jej finansowania. Zaczynało się to jako grupa dżihadystów (czyli walka na drodze Boga) w Afganistanie, znana jako Maktab al-Khidmat lub „urząd usługowy” przeciwko Afgańczykom i Sowietom, a następnie ewoluowała i przekształciła się w globalny ruch dżihadystyczny. Chociaż ruch ten rozpoczął się w Afganistanie, do końca 2008 r. Znaczna większość członków Al-Kaidy pochodziła z kraju.
Doniesiono, że początek talibów został zainicjowany jako reakcja przeciwko przywódcom mudżahedinów, a także sponsorowany przez „Afgański handel tranzytowy” w celu oczyszczenia południowej drogi przez Afganistan. Niektórzy sugerowali również, że talibowie otrzymali wsparcie od CIA i ISI (agencja wywiadu Pakistanu) w celu walki z Sowietami. Od 1994 do 1996 talibowie przejęli kontrolę nad 34 prowincjami. W związku z tym talibowie nałożyli prawo szariatu w Afganistanie i przy pomocy przywódców religijnych w Pakistanie skonsolidowali większą władzę i nałożyli swoje zasady na graniczne obszary Pakistanu.
Ideologia stosowana przez członków Al-Kaidy opiera się na prawie szariatu. Niektórzy sugerują, że pisma Sayyad Qutb lub qutbism wywarły ogromny wpływ na starszych przywódców Al-Kaidy. Zgodnie z qutbizmem islam jest sposobem na życie, a ta ideologia wierzy w koncepcję ofensywnego dżihadu, który jest wojną zbrojną na rzecz rozwoju islamu.
Ideologia, za którą podążali Talibowie, była kombinacją prawa szariatu i kodeksów plemiennych Pasztunów, dzieląc pewne koncepcje dżihadu, a następnie grupy Al-Kaidy. Przestrzegali bardzo surowego kodeksu postępowania, zakazując telewizji i filmów oraz zmuszając mężczyzn i kobiety do przestrzegania talibskiego stroju i talibskiego stylu życia. Ideologia ulegała jednak zmianie w miarę upływu czasu, a później większość decyzji i praw została podjęta i wydana przez samego mułłę Omara.
Przeprowadzono w sumie sześć ataków Al-Kaidy, cztery przeciwko Ameryce. Należą do nich atak bombowy w Aden, Jemen w 1992 r., Atak na World Trade Center w Nowym Jorku, a następnie pod koniec lat 90. w ambasadzie USA w Afryce Wschodniej, w której zginęło 300 osób. Najbardziej niszczycielski atak na World Trade Center w Nowym Jorku 11 września 2001 r. Al-Kaida brała również udział w atakach w Afryce, Europie, na Bliskim Wschodzie i w Kaszmirze.
Taliban zyskał władzę w 1994 r. Wraz z zdobyciem miasta Kandahar i okolic. Taliban otrzymał wsparcie od Jamiat Ulema-e-Islam (JUI) w Pakistanie. Po schwytaniu Kabulu w 1996 r. Talibowie wprowadzili prawo szariatu w Afganistanie, zakazując filmów wideo, tańcząc, przycinając brody mężczyznom, a także zmuszając kobiety do ubierania się i ubierania talibów burki. Surowa kara została nałożona na złodziei i morderców przez „policję religijną”. Talibowie działali w Afganistanie i Pakistanie, a ich członkowie składali się z różnych plemion pasztuńskich i ochotników z innych graniczących krajów islamskich.
Talibowie walczą również z innymi religijnymi ekstremistami w Pakistanie. Na przykład niedawna historia BBC podkreśla atak talibów na bojowników należących do Lashkar-e-Islam w regionie Khyber.
Al-Kaida jest powszechnie uważana za sieć luźno powiązanych grup terrorystycznych, a nie za spójną organizację o strukturze dowodzenia i kontroli i stałej kadrze terrorystów. Chociaż niewiele jest dostępnych informacji na temat Al-Kaidy, pomysł jej organizacji i zarządzania operacjami został przedstawiony Stanom Zjednoczonym przez byłego współpracownika Osamy bin Ladena w zeznaniu. Zgodnie z tym, starszą operacją Al-Kaidy kierował Osama bin Laden i doradzała mu rada składająca się z 20-30 starszych członków Al-Kaidy. Istnieją różne komitety utworzone w celu zarządzania obszarami takimi jak operacje wojskowe, biznes, prawo islamskie i media.
Rząd talibski został opisany jako tajemniczy i dyktatorski i sklasyfikowany jako „rząd alternatywny”. Nie ma partii politycznych i nie odbywają się wybory. Na czele talibów stoi Mullah Mohammed Omar, a jego dowódcami są w dużej mierze madrasa (instytucja edukacyjna ucząca islam) nauczycieli. Kilka sądów szariatu w całym kraju rozpatruje sprawy handlowe i cywilne, w tym pobór podatków.