U prokariotów transkrypcja i translacja zachodzą w cytoplazmie z powodu braku jądra. U eukariotów transkrypcja zachodzi w jądrze, a translacja zachodzi w rybosomach obecnych na szorstkiej błonie endoplazmatycznej w cytoplazmie.
Transkrypcja jest przeprowadzana przez polimerazę RNA i inne powiązane białka określane jako czynniki transkrypcyjne. Może być indukowalny, jak widać w przestrzenno-czasowej regulacji genów rozwojowych lub konsekwentny, jak widać w przypadku genów utrzymujących dom, takich jak Gapdh.
Translacja odbywa się za pomocą struktury wielopodjednostkowej zwanej rybosomem, która składa się z rRNA i białek.
Transkrypcja rozpoczyna się od wiązania polimerazy RNA z regionem promotora w DNA. Czynniki transkrypcyjne i wiązanie polimerazy RNA z promotorem tworzą kompleks inicjacji transkrypcji. Promotor składa się z regionu rdzeniowego, takiego jak pudełko TATA, w którym kompleks się wiąże. Na tym etapie polimeraza RNA rozwija DNA.
Tłumaczenie rozpoczyna się wraz z utworzeniem kompleksu inicjującego. Podjednostka rybosomu, trzy czynniki inicjacji (IF1, IF2 i IF3) i metionina niosąca t-RNA wiążą mRNA w pobliżu kodonu start AUG.
Podczas transkrypcji polimeraza RNA po początkowych nieudanych próbach przechodzi przez nić matrycy DNA w kierunku od 3 'do 5', wytwarzając komplementarną nić RNA w kierunku od 5 'do 3'. W miarę postępu polimerazy RNA nić DNA, która została transkrybowana, przewija się, tworząc podwójną helisę.
Podczas translacji przychodzący t-RNA aminoacylu wiąże się z kodonem (sekwencjami 3 nukleotydów) w miejscu A i między nowym aminokwasem a rosnącym łańcuchem powstaje wiązanie peptydowe. Następnie peptyd przesuwa się o jedną pozycję kodonu, aby przygotować się na następny aminokwas. Proces przebiega zatem w kierunku od 5 'do 3'.
Zakończenie transkrypcji u prokariontów może być albo niezależne od Rho, gdzie powstaje pętla spinki do włosów bogatej w GC, albo zależne od Rho, gdzie czynnik białkowy Rho destabilizuje interakcję DNA-RNA. U eukariotów po napotkaniu sekwencji terminującej powstający transkrypt RNA jest uwalniany i jest poliadenylowany.
W tłumaczeniu, gdy rybosom napotka jeden z trzech kodonów stop, rozkłada rybosom i uwalnia polipeptyd.
Produktem końcowym transkrypcji jest transkrypt RNA, który może tworzyć dowolny z następujących rodzajów RNA: mRNA, tRNA, rRNA i niekodujący RNA (jak mikroRNA). Zwykle u prokariotów powstały mRNA jest policistronowy, a u eukariotów jest monocistronowy.
Produktem końcowym translacji jest łańcuch polipeptydowy, który fałduje się i ulega modyfikacjom po translacji, tworząc funkcjonalne białko.
Podczas modyfikacji po transkrypcji u eukariontów dodaje się czapkę 5 ', ogon poli 3' i introny są rozdzielane. U prokariontów proces ten jest nieobecny.
Występuje szereg modyfikacji potranslacyjnych, w tym fosforylacja, SUMOylacja, tworzenie mostków disiarczkowych, farnezylacja itp..
Transkrypcja jest hamowana przez ryfampicynę (środek przeciwbakteryjny) i 8-hydroksychinolinę (środek przeciwgrzybiczy).
Translacja jest hamowana przez anizomycynę, cykloheksimid, chloramfenikol, tetracyklinę, streptomycynę, erytromycynę i puromycynę.
Do transkrypcji, RT-PCR, mikromacierzy DNA, hybrydyzacji in situ, Northern blot, RNA-Seq jest dość często stosowany do pomiaru i wykrywania. Do tłumaczenia, western blotting, immunoblotting, testu enzymatycznego, sekwencjonowania białek, znakowania metabolicznego, proteomiki stosuje się do pomiaru i wykrywania.
Centralny dogmat Cricka: DNA ---> Transkrypcja ---> RNA ---> Tłumaczenie ---> Białko
Kod genetyczny użyty podczas tłumaczenia: