Różnica między SDS PAGE a elektroforezą żelową

SDS PAGE vs elektroforeza żelowa

Elektroforezę można wykorzystać do ustalenia masy obiektu, zwykle w przypadku białka i kwasu dezoksyrybonukleinowego (DNA). Nić DNA po wprowadzeniu do substancji chemicznych może przyspieszyć lub spowolnić proces informacyjny. Markery DNA o znanej masie są używane do przybliżania wielkości obiektów przemieszczających się po zakończeniu elektroforezy. Elektroforeza jest najprawdopodobniej najczęściej stosowanym narzędziem dla biologów molekularnych i biochemików.

Istnieją dwa rodzaje elektroforezy, które są powszechnie stosowane w tym procesie. Są to elektroforeza w żelu poliakryloamidowym z dodecylosiarczanem sodu (SDS-PAGE) i elektroforeza w żelu natywnym.

SDS-PAGE jest nieselektywną metodą elektroforezy żelowej stosowaną w takich dziedzinach jak: biochemia, kryminalistyka, biologia i genetyka w celu oddzielenia białka od ich ruchliwości elektroforetycznej. SDS jest anionowym środkiem powierzchniowo czynnym, który można stosować do wspomagania lizy komórek podczas ekstrakcji DNA i do oddzielania białek w SDS-PAGE. Podczas elektroforezy mieszaninę białka najpierw upłynnia się w roztworze SDS. Następnie stosuje się substancję zwaną merkaptoeetanolem, aby usunąć wiązania dwusiarczkowe, aby białko było liniowe. Następnie rozpoczyna się elektroforeza. Wyniki dałyby dwie reszty cząsteczek, z których jedną jest SDS-PAGE.

Brak SDS-PAGE nie stanowi problemu, ponieważ elektroforezę żelową nadal można wykonać tylko w taki sposób, że białka nie tracą całej swojej drugorzędowej i trzeciorzędowej struktury i nie otwierają się na zasadniczo proste pręciki.

Tymczasem natywna elektroforeza w żelu wykorzystuje żel jako środek przeciwzapalny. Zwykle stosuje się go do oddzielania makrocząsteczek biologicznych, takich jak DNA, kwas rybonukleinowy (RNA) i białko. Może być również stosowany do separacji nanocząstek.

Istnieją dwa główne żele stosowane w naturalnej elektroforezie żelowej, a mianowicie:

Żel agarozowy stosowany do większych cząsteczek. Ten żel nie identyfikuje małych różnic między dwoma pasmami molekularnymi. Jest również stosowany wyłącznie do separacji DNA. Wizualizacji żelu agarozowego dokonuje się za pomocą mieszanki bromku etydyny.

Żel poliakryloamidowy stosowany do mniejszych cząsteczek. Ten żel identyfikuje różnice między pasmami molekularnymi. Oprócz DNA może także rozdzielać białka.

Streszczenie:

1.SDS-PAGE jest nieselektywną metodą elektroforezy żelowej stosowaną w takich dziedzinach jak: biochemia, kryminalistyka, biologia i genetyka w celu oddzielenia białka od ich ruchliwości elektroforetycznej, podczas gdy elektroforeza żelowa jest zwykle stosowana do oddzielania makrocząsteczek biologicznych, takich jak DNA, kwas rybonukleinowy (RNA) i białko. Może być również stosowany do separacji nanocząstek.

2. Natywna elektroforeza żelowa ma dwa typy, a mianowicie: żel agarozowy i żel poliakryloamidowy.