Endonukleaza vs eksonukleaza
Endonukleaza i egzonukleaza są enzymami nukleazowymi, które katalizują hydrolizę pojedynczych nukleotydów obecnych w łańcuchu DNA. Nukleazy odgrywają istotną rolę w analizie sekwencji nukleotydów w DNA i RNA.
Egzonukleaza
Enzymy egzonukleazy są kategorią enzymów, które tną się do nukleotydów na końcach cząsteczki DNA. Dwie nici DNA wzajemnie się uzupełniają. Są reprezentowane jako ramiona 3 'i 5'. Mostki fosfodiestrowe DNA i RNA są atakowane przez dwie klasy enzymów, które są reprezentowane jako „a” i „b”. Enzymy z grupy „a” specyficznie hydrolizują wiązanie estrowe między węglem 3 ', a grupą fosforową, a enzymy z grupy „b” hydrolizują wiązanie estrowe między węglem 5' i grupą fosforową.
Dobrym przykładem enzymu z grupy egzonukleaz „a” jest jad grzechotnika i żmii Russella. Ten jad hydrolizuje wszystkie wiązania 3 'w DNA lub RNA, uwalniając jednostki nukleotydów jako fosforany nukleozydu 5'.
Enzymy klasy „b” są reprezentowane przez fosfodiesterazę śledziony, która hydrolizuje wszystkie wiązania „b” lub 5 'zarówno DNA, jak i RNA, a zatem uwalnia tylko fosforany nukleozydu 3'.
Endonukleaza
Enzymy endonukleazy są enzymami, które rozszczepiają wiązania DNA z wnętrza cząsteczki. Nie wymagają wolnej grupy hydroksylowej 3 'lub 5' na końcu łańcucha polinukleotydowego. Endonukleazy atakują specyficzne wiązania 3 'lub 5', gdziekolwiek występują w łańcuchu polinukleotydowym.
Endonukleazy są również podzielone na grupy „a” i „b”. Deoksyrybonukleaza I trzustki bydlęcej jest klasyfikowana jako enzym klasy „a” katalizujący hydrolizę niektórych wiązań 3 'DNA w celu otrzymania oligonukleotydów zawierających średnio około czterech reszt nukleotydowych.
Deoksyrybonukleaza II to kolejna endonukleaza klasy „b”. Jest izolowany ze śledziony i grasicy różnych bakterii i powoduje hydrolizę wiązań 5 ', w wyniku czego powstaje grupa nukleotydów.
Streszczenie:
1. egzonukleaza powoduje hydrolizę nukleotydu na końcach, na których w łańcuchu polinukleotydowym występuje wolna grupa hydroksylowa 3 'lub 5', podczas gdy egzonukleaza nie wymaga wolnej grupy hydroksylowej 3 'lub 5', aby spowodować hydrolizę łańcucha polinukleotydowego.
2. Aktywność egzonukleazy powoduje powstanie nukleozydów, podczas gdy aktywność endonukleazy daje oligonukleotydy.
3. Aktywność egzonukleazy powoduje, że małe jednostki łańcucha polinukleotydowego niemal natychmiast, podczas gdy aktywność endonukleazy przechodzi fazę opóźnienia przed uwolnieniem grup oligonukleotydowych.
4. Jad sake i fosfodiesterazy śledziony są przykładami egzonukleaz, podczas gdy deoksyrybonukleaza I i II są przykładami endonukleaz.