Różnica między DNA powyżej i poniżej

Kluczowa różnica - Upstream vs Downstream DNA
 

Ważne jest posiadanie ogólnej wiedzy o składzie i strukturze DNA, aby zrozumieć różnicę między DNA wyższym a niższym. DNA składa się z łańcuchów polinukleotydowych. Nukleotydy są elementami składowymi, które tworzą łańcuchy polinukleotydowe, a każdy nukleotyd składa się z trzech składników: pięciowęglowego cukru, zasady azotowej i grupy fosforanowej. Grupa fosforanowa i grupa OH są przyłączone odpowiednio do węgla w pozycji 5 'i węgla w pozycji 3' cząsteczki cukru w ​​nukleotydu. Nukleotydy są połączone ze sobą wiązaniami fosfodiestrowymi utworzonymi między grupą fosforanową 5 'jednego nukleotydu i grupą OH 3' sąsiedniego nukleotydu. Jeżeli łańcuch polinukleotydowy ma wolną grupę fosforanową 5 ', przypisuje się go jako koniec 5'; jeśli ma wolną grupę 3 'OH, jest ona przypisana jako koniec 3'. Dlatego nici DNA zwykle mają końce 5 'i 3' zgodnie z końcowymi pozycjami łańcuchów polinukleotydowych. DNA istnieje również w postaci dwuniciowej. Dwa pasma są do siebie równoległe. Dlatego DNA ma dwie nici, które biegną w kierunku od 5 'do 3' i od 3 'do 5'. DNA powyżej i poniżej odnosi się do transkrypcji i syntezy nici mRNA od 5 'do 3'. Jeśli rozważa się DNA w kierunku końca 5 nici kodującej od miejsca inicjacji transkrypcji, określa się to jako DNA powyżej. Jeśli rozważa się DNA w kierunku końca 3 'od nici kodującej z miejsca inicjacji transkrypcji, określa się to jako DNA poniżej. Jest to kluczowa różnica między DNA powyżej i poniżej.

ZAWARTOŚĆ
1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to jest Upstream DNA
3. Co to jest DNA niższego szczebla
4. Porównanie obok siebie - DNA upstream vs downstream
5. Podsumowanie

Co to jest Upstream DNA?

Gen jest strukturalną i funkcjonalną dziedzicznością jednostkową, która znajduje się w DNA organizmu. Jest przechowywany z instrukcjami budowy białka. Gen ma specyficzny region cząsteczki DNA. W razie potrzeby transkrybuje i przekształca się w białko poprzez syntezę nici mRNA. Normalnie nić kodująca genu biegnie od kierunku 5 'do 3'. Kiedy jest transkrybowany, wytwarza nić mRNA w tym samym kierunku od 5 'do 3'. Podczas transkrypcji nić antysensowna 3 'do 5' służy jako nić matrycy i inicjuje syntezę mRNA. W genie znajduje się miejsce inicjacji transkrypcji. W odniesieniu do miejsca inicjacji transkrypcji region DNA w kierunku końca 5 'nici kodującej jest znany jako DNA powyżej. Promotor genu zwykle znajduje się w górnym obszarze DNA. W genach eukariotycznych są pola TATA, elementy proksymalne promotora i wzmacniacze w obszarze powyżej genu. Region powyżej genu jest określany liczbami ujemnymi. DNA genu powyżej ma ogromne znaczenie dla transkrypcji.

Co to jest DNA niższego szczebla?

Miejsce inicjacji transkrypcji jest znane jako punkt +1 genu. Region DNA od punktu +1 w kierunku końca 3 'nici kodującej jest znany jako DNA poniżej. Innymi słowy, poniżej genu jest od miejsca inicjacji transkrypcji w kierunku końca 5 'nici matrycy. Dlatego DNA poniżej regionu genu obejmuje jednostkę transkrypcyjną i inne sekwencje, takie jak sekwencja terminatora. Promotor może wpływać na kolejną sekwencję genu. Dolna część genu jest określana liczbami dodatnimi. DNA genu poniżej jest faktycznym regionem, który daje produkt białkowy.

Rycina 01: Upstream i Downstream DNA

Jaka jest różnica między DNA upstream a downstream?

Upstream vs Downstream DNA
Region DNA w kierunku końca 5 'sekwencji kodującej od miejsca inicjacji transkrypcji jest znany jako DNA powyżej.	Region DNA w kierunku końca 3 'nici kodującej od miejsca inicjacji transkrypcji jest znany jako DNA poniżej.
Elementy
Promotory i wzmacniacze znajdują się w górnym DNA	Jednostka transkrypcyjna i sekwencje terminatora znajdują się w dalszym DNA.
Numeracja
Nukleotydy w górnym regionie są oznaczone liczbami ujemnymi	Nukleotydy są oznaczone liczbami dodatnimi.
Funkcjonować
Ten region zawiera elementy niezbędne do regulacji i zainicjowania transkrypcji	Ten region zawiera instrukcje dotyczące wytwarzania białka i zakończenia transkrypcji

Podsumowanie - Upstream vs Downstream DNA

Łatwo jest zidentyfikować powyżej i poniżej nici RNA. W odniesieniu do miejsca odniesienia region w kierunku końca 5 'nici RNA jest znany jako górny RNA, natomiast region w kierunku końca 3' jest znany jako dolny RNA. Jednak w DNA istnieją dwie nici, które biegną w obu kierunkach od 5 'do 3' i od 3 'do 5'. Dlatego różnica między DNA powyżej i poniżej jest skomplikowana. Dlatego jest zróżnicowany w odniesieniu do transkrypcji genu. Od miejsca inicjacji transkrypcji w kierunku 5 końca nici sensownej region DNA jest znany jako DNA powyżej, natomiast od miejsca inicjacji transkrypcji w kierunku końca 3 'nici sensownej jest znany jako DNA poniżej. To jest różnica między górnym i dolnym odcinkiem DNA.

Bibliografia:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi i Jonatha M. Gott. „Odrębne role dla sekwencji powyżej i poniżej miejsc Physarumediting”. RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, wrzesień 2009. Web. 18 marca 2017 r

Zdjęcie dzięki uprzejmości:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro i Luísa Romão. „Regulacja ekspresji genów przez otwarte ramy odczytu i choroby ludzkie”. PLOS Genetics. Public Library of Science, n.d. Sieć. 18 marca 2017 r.