Różnica między ukierunkowaną i nieukierunkowaną proteomiką

Kluczową różnicą między ukierunkowaną i nieukierunkowaną proteomiką jest to, że ukierunkowana proteomika ma na celu pomiar obfitości określonego białka, podczas gdy proteomika nieukierunkowana nie jest ukierunkowana na konkretne białko.

Proteomika to szeroko zakrojone badanie białek, ich struktur i funkcji. Bada cały dopełniacz białka w komórce, tkance lub organizmie w określonych warunkach. Istnieją dwa rodzaje proteomiki: proteomika celowana i proteomika nieukierunkowana.

ZAWARTOŚĆ

1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to jest ukierunkowana proteomika
3. Co to jest proteomika nieukierunkowana
4. Podobieństwa między ukierunkowanymi i nieukierunkowanymi białkami
5. Porównanie obok siebie - ukierunkowane i nieukierowane proteomiki w formie tabelarycznej
6. Podsumowanie

Co to jest ukierunkowana proteomika?

Jak sama nazwa wskazuje, ukierunkowana proteomika jest ukierunkowana na określone białko lub peptyd w złożonej mieszaninie białek do analizy. Następnie analizuje obecność i ilość tego wstępnie wybranego określonego białka. Ta metoda jest możliwa tylko dla jednej próbki lub wielu próbek. Ta metoda jest odpowiednia nawet dla określonej grupy białek. Daje to dokładniejsze, ilościowe i wrażliwe dane. Ponadto spektrometria masowa w połączeniu z ukierunkowaną proteomiką daje dokładniejsze i bardziej wiarygodne pomiary. Ta metoda wykorzystuje do analizy potrójny kwadrupolowy spektrometr masowy (QQQ).

Ryc. 01: Proteomika

Ukierunkowana proteomika jest odpowiednią metodą, jeśli chcesz sprawdzić, czy cel powalenia jest rzeczywiście powalony lub jeśli chcesz określić ilościowo konkretne białko / peptyd w surowicy krwi, płynie mózgowym lub w lizacie komórkowym itp. Możesz go również użyć, jeśli chcesz w celu sprawdzenia, czy dane białko ulega ekspresji różnicowej w próbkach lub w trakcie eksperymentu w czasie.

Co to jest proteomika nieukierunkowana?

Nieukierunkowana proteomika, jak sama nazwa wskazuje, nie jest ukierunkowana na konkretne białko lub peptyd do analizy. Odkrycie proteomiki to inna nazwa dla nieukierunkowanej proteomiki. W rzeczywistości jest to bardziej „globalna” analiza. Zasadniczo wykonywanie proteomiki nieukierunkowanej polega na odpowiedzi na pytanie „jakie białko lub białka znajdują się w tej próbce lub w wielu próbkach?”. Ta metoda nie jest wrażliwa jako ukierunkowana proteomika. Ale może zidentyfikować i zmierzyć wiele białek, w tym nowe białka. Nieukierunkowana proteomika może wytwarzać pomiary zarówno ilościowe, jak i jakościowe.

Jakie są podobieństwa między ukierunkowanymi a nieukierunkowanymi białkami?

• Zarówno ukierunkowana, jak i nieukierunkowana proteomika mierzy białka w próbkach.
• Są ważne w analizie proteomu.
• Te metody wykorzystują spektrometrię mas.

Jaka jest różnica między ukierunkowanymi a nieukierunkowanymi białkami?

Po pierwsze, ukierunkowana proteomika polega na określeniu obecności i ilości konkretnego białka lub peptydu w złożonej mieszaninie białek. Natomiast nieukierunkowana proteomika to badanie ilościowe i jakościowe białek obecnych w próbce lub próbkach bez ukierunkowania na konkretne białko. Ukierunkowana proteomika jest wykonywana z wcześniej wybranymi lub docelowymi białkami, podczas gdy nieukierunkowana proteomika jest wykonywana w celu ustalenia rodzajów białek w tej próbce. Ponadto ukierunkowana proteomika jest bardziej czuła niż proteomika nieukierunkowana.

Podsumowanie - ukierunkowana i nieukierunkowana proteomika

Podsumowując, ukierunkowana i nieukierunkowana proteomika to dwa rodzaje badań białek. Jak sugerują ich nazwy, ukierunkowana proteomika jest ukierunkowana na określone białko, podczas gdy proteomika nieukierunkowana nie jest ukierunkowana na konkretne białko. Jest to różnica między ukierunkowaną a nieukierunkowaną proteomiką.

Odniesienie:

1. „Ukierunkowana proteomika”. UC Davis Proteomics Core, dostępny tutaj.
2. „Proteomika / Wprowadzenie do proteomiki”. Teoria muzyki / tryby - Wikibooks, Otwarte książki dla otwartego świata, Dostępne tutaj.

Zdjęcie dzięki uprzejmości:

1. „Proteomics” Autor: Xxl7441 z angielskiej Wikibooks - przeniesiony z en.wikibooks do Commons (domena publiczna) przez Commons Wikimedia