Różnica między ukorzenionym a nieukorzenionym drzewem filogenetycznym

Kluczowa różnica - ukorzenione vs nieukorzenione drzewo filogenetyczne
 

Filogeneza to ważne pole, które eksploruje życie na ziemi w czasie. Ujawnia związek między organizmami z ich przodkami i potomkami. Zależności między organizmami są schematycznie reprezentowane przez różne reprezentacje drzewiaste, takie jak dendogram, kladogram, fenogram, filogram itp. Drzewo filogenetyczne jest drzewiastym diagramem rozgałęziającym, który wyjaśnia zależności filogenetyczne między organizmami za pomocą odległości ewolucyjnej. Istnieją dwa główne typy drzew filogenetycznych znane jako ukorzenione i nieukorzenione. Kluczową różnicą między zakorzenionym i nieukorzenionym drzewem filogenetycznym jest to ukorzenione drzewo pokazuje najbardziej podstawowego przodka drzewa podczas nieukończony drzewo filogenetyczne nie wykazuje korzenia przodka.

ZAWARTOŚĆ
1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to jest ukorzenione drzewo filogenetyczne
3. Co to jest nieukorzenione drzewo filogenetyczne
4. Porównanie obok siebie - ukorzenione vs nieukorzenione drzewo filogenetyczne
5. Podsumowanie

Co to jest ukorzenione drzewo filogenetyczne?

Ukorzenione drzewo filogenetyczne służy jako przydatny schemat przedstawiający historię ewolucji. Ma podstawowy węzeł zwany korzeniem, reprezentujący wspólnego przodka wszystkich grup drzewa. Korzeń drzewa jest uważany za najstarszy punkt w drzewie, który reprezentuje ostatniego wspólnego przodka wszystkich grup zawartych w drzewie. Zatem ukorzenione drzewo wskazuje kierunek czasu ewolucji. Z jednego gatunku ukorzenionego drzewa można znaleźć wspólnego przodka lub przodka gatunku, śledząc z powrotem do węzła podstawowego. Ponieważ ukorzenione drzewo przedstawia kierunek czasu ewolucji, łatwo jest znaleźć starsze lub nowsze grupy, które posiada. Ukorzenione drzewo można wykorzystać do badania całych grup organizmów. Dokładne ukorzenienie drzewa filogenetycznego jest ważnym i kluczowym czynnikiem, ponieważ niedokładne ukorzenienie może spowodować błędną interpretację zmian genetycznych między organizmami i ich kierunkowość ewolucji.

Rycina 01: Ukorzenione drzewo filogenetyczne

Co to jest nieukorzenione drzewo filogenetyczne?

Nieukorzenione drzewo filogenetyczne to diagram filogenetyczny, w którym brakuje wspólnego przodka lub węzła podstawowego. Ten typ drzewa nie wskazuje na pochodzenie ewolucji grup interesów. Przedstawia jedynie związek między organizmami, niezależnie od kierunku ewolucyjnej linii czasu. Dlatego trudno jest badać relacje ewolucyjne grup w odniesieniu do czasu za pomocą nieukorzenionego drzewa.

Istnieją dwa główne sposoby na ukorzenienie nieukorzenionego drzewa filogenetycznego. Oni są

• Znalezienie grupy zewnętrznej - Wymaga to wcześniejszej wiedzy na temat związków między taksonami. Następnie takson leżący poza grupą można wykorzystać jako grupę zewnętrzną do narysowania ukorzenionego drzewa filogenetycznego

• Znajdowanie punktu środkowego lub odległości - Punkt środkowy najbardziej odległych dwóch taksonów w drzewie można założyć jako korzeń drzewa filogenetycznego.

Ryc. 02: Nieukorzenione drzewo filogenetyczne

Jaka jest różnica między ukorzenionym a nieukorzenionym drzewem filogenetycznym?

Ukorzenione vs nieukorzenione drzewo filogenetyczne
Ukorzenione drzewo filogenetyczne to schemat przedstawiający ostatniego wspólnego przodka grup.	Nieukorzenione drzewo filogenetyczne pokazuje relacje między organizmami, nie pokazując wspólnego przodka.
Węzeł
Ma węzeł (root).	Nie ma węzła.
Kierunek ewolucji
Ma kierunek wskazujący czas ewolucji.	Nie określa relacji ewolucyjnej.
Stosunek do innych
Drzewo pozwala na określenie relacji przodek-potomek między grupami.	Drzewo nie pozwala mówić o relacji przodek-potomek.

Podsumowanie - ukorzenione vs nieukorzenione drzewo filogenetyczne

Drzewo filogenetyczne reprezentuje ścieżki ewolucyjne i połączenia między organizmami za pomocą rozgałęzionych diagramów przypominających drzewa. Warkocz filogenetyczny może być zrootowany lub wykorzeniony. Zrootowane drzewo ma węzeł u podstawy, reprezentujący wspólnego przodka, który łączy wszystkie grupy interesów. Nieukorzenione drzewo pokazuje relacje między organizmami. Jednak nie przedstawia wspólnego przodka, z którym korzystają wszystkie grupy. Na tym polega różnica między ukorzenionym a nieukorzenionym drzewem filogenetycznym.

Bibliografia:
1. Fakty „Drzewo”: drzewa ukorzenione a drzewa nieukorzenione. ” Narodowe Centrum Informacji Biotechnologicznej. U.S. National Library of Medicine, n.d. Sieć. 04 kwietnia 2017 r
2. Graham, Sean W., Richard G. Olmstead i Spencer C. H. Barrett. „Rootowanie drzew filogenetycznych za pomocą odległych grup zewnętrznych: studium przypadku Monocots Commelinoid”. Biologia molekularna i ewolucja. Oxford University Press, 01 października 2002. Web. 04 kwietnia 2017 r