Różnica między rozwiązaniem zależnym od Rho a niezależnym rozwiązaniem Rho

The kluczowa różnica między terminacją zależną od Rho a niezależnym terminacją Rho jest to, że w Zakończenie zależne od Rho, czynnik Rho wiąże się z transkryptem i kończy transkrypcję poprzez zerwanie wiązań wodorowych między matrycą a transkryptem, podczas gdy niezależne zakończenie Rho kończy transkrypcję przez wytworzenie struktury pętli spinki do włosów, a następnie regionu bogatego w U w transkrypcie.

Transkrypcja jest jednym z dwóch etapów ekspresji genów. Jest to proces, który wytwarza sekwencję mRNA z informacji genetycznej ukrytej w sekwencji DNA genu. Transkrypcja odbywa się w trzech etapach: inicjacji, wydłużenia i zakończenia. Enzym polimerazy RNA wiąże się z sekwencją promotora genu i zaczyna katalizować syntezę nici RNA. Do momentu znalezienia sekwencji terminatora polimeraza RNA dodaje nukleotydy i buduje nić RNA. U prokariontów zakończenie następuje przez dwie główne strategie zakończenia: zakończenie zależne od Rho i zakończenie niezależne od Rho. Czynnik Rho jest białkiem o aktywności helikazy.

ZAWARTOŚĆ

1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to jest wypowiedzenie zależne od Rho
3. Co to jest niezależne zakończenie Rho
4. Podobieństwa między rozwiązaniem zależnym od Rho a niezależnym rozwiązaniem Rho
5. Porównanie obok siebie - Zależne od Rho vs Niezależne zakończenie Rho w formie tabelarycznej
6. Podsumowanie

Co to jest zakończenie zależne od Rho?

Terminacja zależna od Rho jest jednym z dwóch rodzajów strategii terminacji transkrypcji występującej u prokariotów. Czynnik Rho jest białkiem o aktywności helikazy.

Rysunek 01: Zakończenie zależne od Rho

Białko Rho wiąże się z transkryptem RNA i porusza się wzdłuż polimerazy RNA w kierunku 5'-3 ', zachęcając do dysocjacji wiązań wodorowych między matrycą DNA a transkryptem RNA. Gdy czynnik Rho dociera do pęcherza transkrypcyjnego, rozdziela hybrydę DNA / RNA i uwalnia transkrypt z pęcherza transkrypcyjnego. Gdy to nastąpi, kończy transkrypcję.

Co to jest niezależne zakończenie Rho?

Niezależne zakończenie Rho jest drugą strategią, która kończy transkrypcję prokariotyczną. Zwykle region terminatora ma odwróconą sekwencję powtarzania. Bezpośrednio po odwróconej sekwencji powtórzeń znajduje się region bogaty w adeninę (AAAA). Gdy polimeraza RNA porusza się do przodu, wytwarza sekwencję mRNA. Ponieważ dwa regiony są komplementarne w regionie odwróconej sekwencji powtórzeń, tworzy strukturę pętli spinki do włosów z powodu wiązania wodorowego. Następny region będzie regionem bogatym w U. Struktura spinki do włosów przerywa aktywność polimerazy RNA.

Rysunek 02: Niezależne zakończenie Rho

Ponadto w regionach bogatych w U występują słabe interakcje między zasadami U transkryptu i zasadami A szablonu. Te słabe wiązania Adenina-Uracil destabilizują matrycę DNA i transkrypt RNA i rozdzielają się. W końcu transkrypt uwalnia się z miejsca transkrypcji.

Jakie są podobieństwa między Rho Dependent a Rho Independent Termination?

• Terminacja zależna od Rho i niezależna od Rho to dwie główne strategie terminacji u prokariontów.
• Obie formy uwalniają transkrypt z matrycy DNA, aby zakończyć transkrypcję.

Jaka jest różnica między Rho Dependent i Rho Independent Termination?

Zakończenie zależne od Rho odbywa się za pośrednictwem białka Rho, natomiast zakończenie niezależne Rho następuje przez utworzenie struktury pętli spinki do włosów. Jest to więc kluczowa różnica między terminacją zależną od Rho a terminacją niezależną od Rho. Ponadto białko Rho wykorzystuje energię ATP, a niezależne zakończenie Rho nie obejmuje białka Rho i nie wykorzystuje energii ATP. Dlatego jest to również znacząca różnica między terminacją zależną od Rho a terminacją niezależną od Rho.

Poniższa infografika pokazuje więcej porównań związanych z różnicą między zależnym od Rho zakończeniem niezależnym od Rho.

Podsumowanie - Rho Dependent vs Rho Independent Termination

Terminacja zależna od Rho i niezależna od Rho to dwa główne mechanizmy terminacji transkrypcji występujące u prokariotów. Białko Rho jest odpowiedzialne za zakończenie transkrypcji w terminacji zależnej od Rho. W przeciwieństwie do tego, niezależne zakończenie Rho następuje przez utworzenie struktury pętli spinki do włosów. Jest to więc kluczowa różnica między terminacją zależną od Rho a niezależną od Rho.

Odniesienie:

1. „Etapy transkrypcji”. Khan Academy, dostępna tutaj.
2. „Rozwiązanie wewnętrzne”. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 8 lutego 2019 r., Dostępna tutaj.

Zdjęcie dzięki uprzejmości:

1. „Terminator zależny od Rho” Autor: Oalnafo1 - Praca własna (CC BY-SA 3.0) przez Commons Wikimedia
2. „Terminator niezależny od Rho” Autor: Ppgardne z angielskiej Wikipedii (CC BY-SA 3.0) przez Commons Wikimedia