Różnica między polimerem Phusion i Taq

Kluczowa różnica - Phusion vs Taq Polimeraza
 

Polimerazy DNA są szeroko stosowanymi enzymami w technikach biologii molekularnej i są również naturalnie obecne we wszystkich organizmach, które ulegają replikacji DNA. Są to kluczowe enzymy polimeryzujące, które biorą udział podczas replikacji. Polimeraza DNA jest zdolna do dodawania nukleotydów do wolnego końca 3 'nici DNA, powodując w ten sposób wydłużenie nowej nici. Obecnie, ze względu na rozwój biologii molekularnej w diagnostyce chorób i zastosowaniach przemysłowych, ważne jest wytwarzanie polimerazy o różnych korzystnych właściwościach. Zwiększa to dokładność metody i czyni ją szybszą techniką. Polimeraza Phusion i Taq to dwa komercyjnie produkowane termostabilne enzymy polimerazy, które są stosowane w specjalnych zastosowaniach molekularnych. Phusion to polimeraza DNA wyizolowana z Pyrococcus furiosus i jest głównie używany w eksperymentach klonowania w celu zwiększenia wierności. Polimeraza DNA Taq jest standardową polimerazą DNA stosowaną w reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) i jest izolowana od bakterii termostabilnej; Thermus aquaticus. The kluczowa różnica między dwoma enzymami jest mikroorganizm źródłowy. Fuzja jest izolowana od ekstremofila, Pyrococcus furiosus podczas gdy polimeraza Taq jest izolowana z termofilu, Thermus aquaticus.

ZAWARTOŚĆ

1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to jest Phusion
3. Co to jest polimeraza Taq
4. Podobieństwa między polimerem Phusion i Taq
5. Porównanie obok siebie - Phusion vs Taq Polimeraza w formie tabelarycznej
6. Podsumowanie

Co to jest Phusion?

Polimeraza DNA Phusion to nowa polimeraza wytwarzana przez izolację enzymu Pyrococcus furiosus, który jest ekstremofilnym archeonem. Mikroby te występują w ekstremalnie wysokich temperaturach, dzięki czemu polimeraza jest polimerem wysoce stabilnym termicznie. Polimerazę fuzyjną stosuje się w celu uzyskania ekstremalnej wierności w stosunku do konwencjonalnej termostabilnej polimerazy; Polimeraza Taq. Polimeraza fuzji jest zdolna do amplifikacji długich matryc do 7,5 kb genomowego DNA. Optymalna zdolność polimeryzacji polimerazy Phusion wynosi 72⁰ C. Fuzja jest również stosowana w produktach do klonowania do sekwencjonowania, analizy ekspresji i analizy mutacji.

Faza polimerazy DNA ma aktywność egzonukleazy 3 '- 5'. Pozwala to na korektę nowo zsyntetyzowanej nici po syntezie. Dlatego niedopasowania nukleotydów można łatwo naprawić. W związku z tym ma mniejszy poziom błędu. Ogólne zalety polimerazy Phusion są;

• Niezwykła wierność
• Wysoka prędkość i skrócony czas przedłużenia
• Solidne reakcje i wymaga minimalnej optymalizacji
• Wysoka wydajność

Ryc. 01: Fuzja

Główną wadą polimerazy Phusion jest to, że jest ona hamowana w obecności trifosforanu dezoksyurydyny (dUTP). Gdy dUTP gromadzą się w mieszaninie reakcyjnej, może to hamować działanie polimerazy Phusion. Zapobiega się temu przez traktowanie mieszaniny reakcyjnej dUTPazą przed dodaniem enzymu. Obecnie zamiast polimerazy Phusion stosuje się wariant polimerazy Phusion odporny na dUTP znany jako Pfu Turbo jako rozwiązanie tego problemu.

Co to jest polimeraza Taq?

Polimeraza DNA Taq wynalazek zrewolucjonizował dziedzinę biologii molekularnej. Rozwiązało to poważny problem w amplifikacji DNA. Polimeraza DNA Taq jest stabilnym termicznie enzymem polimerazy ekstrahowanym i izolowanym z bakterii termofilnej, Thermus aquaticus. Odkrycie tych enzymów prowadzi do rozwoju PCR. Enzym ten umożliwił zastosowanie reakcji łańcuchowej polimerazy do amplifikacji DNA zamiast konwencjonalnych pracochłonnych technik klonowania. PCR jest obecnie stosowany w diagnostyce molekularnej, w rolnictwie i przemyśle, a do techniki dodano wiele nowych odmian.

Rycina 02: Polimeraza Taq

Polimeraza DNA Taq działa w optymalnym zakresie temperatur między 72⁰C - 80⁰C. Polimeraza DNA Taq wymaga kofaktora; magnez dla swojej funkcji. Polimeraza Taq nie ma możliwości korekty 3 '- 5', dlatego wskaźnik błędów polimerazy DNA Taq jest wysoki w porównaniu z nowszymi typami polimerazy DNA, takimi jak polimerazy Phusion itp. Jednak popularność polimerazy Taq DNA pozostaje to samo na całym świecie nauki ze względu na wygodę i elastyczność enzymu.

Jakie są podobieństwa między polimerem Phusion i Taq?

• Enzymy polimerazy Phusion i Taq są enzymami polimeryzującymi, które są zdolne do dodawania nukleotydów do wolnego końca 3 'nici DNA.
• Zarówno polimerazy Phusion, jak i Taq wymagają sekwencji starterów do zainicjowania polimeryzacji.
• Polimerazy Phusion i Taq są stabilne termicznie.
• Zarówno polimerazy Phusion, jak i Taq są stosowane w mechanizmach PCR do amplifikacji DNA.
• Podczas dodawania polimerazy do mieszaniny reakcyjnej na końcu dodaje się zarówno polimerazy Phusion, jak i Taq, aby zapewnić wydajność enzymu.
• Zarówno polimerazy Phusion, jak i Taq są komercyjnie syntetyzowane do celów eksperymentalnych w biologii molekularnej.
• Zarówno polimerazy Phusion, jak i Taq wymagają kofaktora, aby wypełnić swoją funkcję.

Jaka jest różnica między Phusion a polimerazą Taq?

Phusion kontra polimeraza Taq
Phusion to polimeraza DNA wyizolowana z Pyrococcus furiosus i jest głównie używany w eksperymentach klonowania w celu zwiększenia wierności.	Polimeraza DNA Taq jest standardową polimerazą DNA stosowaną w reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) i jest izolowana od bakterii termostabilnej, Thermus aquaticus.
Organizm źródłowy
Fuzja jest wydobywana z ekstremofilnych archeonów - Pyrococcus furiosus.	Te dzieła literackie obejmują okres od kolonizacji do okresu dekolonizacji.
Umiejętność czytania dowodu
Umiejętność czytania dowodu 3 '- 5' jest obecna w Phusion.	W polimerazie Taq nie ma możliwości odczytu dowodu 3 '- 5'.
wierność
Dzięki Phusion istnieje wysoka wierność.	Polimeraza Taq wykazuje niską wierność.
Wzmocnienie
Phusion jest zdolny do amplifikacji długich fragmentów DNA.	Polimeraza Taq jest zdolna do amplifikacji znacznie krótszych fragmentów DNA.
Zatrucie DUTP
Działanie fuzji jest hamowane przez nieparzystą akumulację.	DUPT nie hamuje polimerazy Taq.

streszczenie - Phusion vs Taq polimeraza

Polimerazy Phusion i Taq DNA to dwie stabilne termicznie polimerazy, które są stosowane w technikach PCR. Fuzja to polimeraza izolowana z ekstremofilu, Pyrococcus furiosus podczas gdy Taq jest izolowany od bakterii termostabilnych Thermus aquaticus. Odkrycie polimerazy Taq DNA prowadzi do wynalazku PCR. Phusion ma wiele zalet w stosunku do Taq, dzięki czemu Phusion jest lepszą opcją w wytwarzaniu DNA o wysokiej wierności. Jednak polimeraza Taq jest nadal stosowana jako standardowy enzym polimerazy w PCR. To jest różnica między polimerem Phusion i Taq.

Odniesienie:

1.Biolabs, Nowa Anglia. „Polimerazy Taq DNA”. New England Biolabs: Reagents for the Life Sciences Industry. Dostępny tutaj  
2. „Polimeraza DNA Phusion”. New England Biolabs. Dostępny tutaj 

Zdjęcie dzięki uprzejmości:

1.'GAM ilustrowany przez Nivin Nasri'By NivinN - Praca własna, (CC BY-SA 4.0) przez Commons Wikimedia  
2.'Taq'By Adenozyna - Praca własna (CC BY-SA 3.0) przez Commons Wikimedia