Różnica między motywem a domeną

The kluczowa różnica między motywem a domeną jest to, że motyw nie jest niezależnie stabilny, podczas gdy domena jest niezależnie stabilna.

Białka są ważnymi makrocząsteczkami biologicznymi obecnymi w naszym ciele. Z drugiej strony, kod genetyczny genu decyduje o sekwencji aminokwasowej białka. Ponadto białka mają struktury pierwotne, drugorzędne i trzeciorzędowe. Podstawową strukturą jest sekwencja aminokwasowa łańcucha polipeptydowego. Kiedy łańcuchy polipeptydowe składają się ze sobą, tworzy się wtórna struktura białka. Helisy alfa, arkusze beta i struktury ponadpodstawowe należą do struktur drugorzędnych. Niektóre grupy pierwiastków wtórnych są znane jako motywy białkowe. Trzeciorzędowa struktura białka odnosi się do jego trójwymiarowej struktury, która decyduje o funkcji białka. Domena to zwinięty odcinek cząsteczki białka, która jest kulista i pełni funkcję dyskretną. Jest to podstawowa funkcjonalna i trójwymiarowa struktura białka.

ZAWARTOŚĆ

1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to jest motyw
3. Co to jest domena
4. Podobieństwa między motywem a domeną
5. Porównanie obok siebie - Motyw vs. Domena w formie tabelarycznej
6. Podsumowanie

Co to jest motyw?

Motyw jest pewną grupą super drugorzędnych elementów białek, takich jak helisy alfa i struktury beta. Są to pewnego rodzaju wzory obecne w różnych białkach. Motywy opisują wzory składania drugorzędnych elementów konstrukcyjnych i ich wzajemne oddziaływania. Te wzory składania stabilizują się za pomocą podobnych połączeń, które są obecne w strukturach trzeciorzędowych. Nie są one jednak tak złożone jak struktury trzeciorzędowe.

Rysunek 01: Motyw

Są to proste kombinacje wtórnych struktur białek. Motyw sam w sobie nie jest stabilny. Ponadto motywy wyjaśniają budowę białka, ale nie przewidują funkcji białka. Przykładami motywów białkowych są motyw beta-alfa-beta, motyw klucza greckiego, beczka Beta, motyw Beta-meander itp..

Co to jest domena?

Domena jest podstawową, funkcjonalną i trójwymiarową jednostką białka. Pełni określoną funkcję. Pojedyncze białko może mieć kilka różnych domen. Każda domena jest niezależną jednostką. Jest to struktura globularna. Odpowiada za określoną funkcję lub interakcję. Domeny można wykorzystać do postawienia hipotezy o funkcji niescharakteryzowanego białka. Analizując białko, należy wziąć to pod uwagę, ponieważ domeny są jednostkami funkcjonalnymi białka.

Rycina 02: Trzy różne domeny kinazy pirogronianowej

Domeny są bardzo stabilnymi i zwartymi strukturami. Można je łatwo odróżnić od innych regionów. Kinaza pirogronianowa ma trzy odrębne domeny, jak pokazano na figurze 02. Długość domeny może się różnić, a średnia długość wynosi 100 aminokwasów. Każda domena zawiera hydrofobowy rdzeń zbudowany z drugorzędnych jednostek strukturalnych. Kilka domen łącznie tworzy trzeciorzędową strukturę białka.

Jakie są podobieństwa między motywem a domeną?

• Motyw i domena są jednostkami obecnymi w samych cząsteczkach białka.
• Są przydatne podczas klasyfikacji rodzin białek.

Jaka jest różnica między motywem a domeną?

Motyw jest pewną grupą super drugorzędnych elementów białek, takich jak helisy alfa i struktury beta, podczas gdy domena jest jednostką funkcjonalną białka. Ponadto motyw jest strukturą wtórną, podczas gdy domena jest odpowiedzialna za trzeciorzędową strukturę białka. Ponadto domena jest niezależną jednostką, w przeciwieństwie do motywu. Domena przedstawia także funkcję białka, podczas gdy motyw nie jest. Są to główne różnice między motywem a domeną. Poniższa infografika przedstawia różnicę między motywem a domeną w formie tabelarycznej.

Podsumowanie - Motyw vs. Domena

Motyw jest układem drugorzędowych struktur cząsteczki białka. Zwykle sama w sobie nie jest stabilna, w przeciwieństwie do domeny. Domena jest niezależnie stabilną strukturą białka. Dlatego może to być cząsteczka częściowa lub cała białka. Jest to trójwymiarowa podstawowa jednostka funkcjonalna białka. Co więcej, ma funkcję i jest niezależną jednostką. Motyw może być częścią domeny. Ale domena nie może być częścią motywu. To jest różnica między motywem a domeną.

Odniesienie:

1. „Domena białkowa”. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 31 lipca 2018 r. Dostępne tutaj

Zdjęcie dzięki uprzejmości:

1. „Kluczowy motyw białka toksyny wąglika” Autor: Natelewis Praca pochodna (CC BY-SA 3.0) przez Commons Wikimedia
2. „Domeny białkowe kinazy pirogronianowej” Autor: Thomas Splettstoesser - Praca własna (CC BY-SA 3.0) przez Commons Wikimedia