Różnica między ogólnymi i specyficznymi czynnikami transkrypcyjnymi

Kluczowa różnica - ogólne a określone czynniki transkrypcji
 

Czynniki transkrypcyjne są wymagane przez polimerazę RNA do działania na nić matrycy DNA w syntezie mRNA. Istnieją różne rodzaje czynników transkrypcyjnych. Te czynniki transkrypcyjne tworzą kompleks z nicią DNA. Zmieniają one potwierdzenie nici matrycy lub zwiększają powinowactwo enzymu polimerazy RNA do syntezy mRNA w procesie zwanym transkrypcją. Istnieją dwa główne typy czynników transkrypcji. Są to ogólne lub podstawowe czynniki transkrypcyjne oraz specyficzne czynniki transkrypcyjne. Ogólne czynniki transkrypcji są czynnikami stosowanymi do utworzenia kompleksu przedinicjacyjnego podczas procesu transkrypcji. Są obecne u prawie wszystkich eukariontów, a u prokariotów tworzą mniej skomplikowany kompleks. Specyficzne czynniki transkrypcyjne są wzmacniaczami lub represorami, które są specyficznymi sekwencjami DNA, które aktywują lub represjonują ogólny proces transkrypcji. Niektóre specyficzne czynniki transkrypcyjne mogą zmieniać samą sekwencję DNA. The kluczowa różnica pomiędzy ogólnymi czynnikami transkrypcyjnymi a konkretnymi czynnikami transkrypcyjnymi zależy od funkcjonalności. Ogólne czynniki transkrypcyjne biorą udział w tworzeniu kompleksu przedinicjacyjnego procesu transkrypcji, podczas gdy konkretne czynniki transkrypcyjne biorą udział w aktywacji lub represji procesu transkrypcji.

ZAWARTOŚĆ

1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Jakie są ogólne czynniki transkrypcji
3. Jakie są szczególne czynniki transkrypcji
4. Podobieństwa między ogólnymi i specyficznymi czynnikami transkrypcyjnymi
5. Porównanie obok siebie - Ogólne vs określone czynniki transkrypcyjne w formie tabelarycznej
6. Podsumowanie

Jakie są ogólne czynniki transkrypcji?

Ogólne lub Podstawowe czynniki transkrypcyjne są czynnikami zaangażowanymi w tworzenie kompleksu inicjującego podczas transkrypcji. Są niezbędne w procesie transkrypcji, dlatego odgrywają istotną rolę w udanej transkrypcji. Istnieje sześć kluczowych ogólnych czynników transkrypcji. Oni są; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF i TFIIA. Odgrywają one różne role podczas tworzenia kompleksu inicjacyjnego.

  1. TFIID - Ten czynnik transkrypcyjny (TF) bierze udział w rozpoznawaniu sekwencji promotora (ramka TATA).
  2. TFIIB - Kompleks promotor / TFIID jest rozpoznawany przez TFIIB. To daje sygnał do wiązania głównego enzymu katalizującego polimerazę RNA.
  3. TFIIF - Ten czynnik transkrypcyjny jest związany z polimerazą RNA. TFIIF bierze zatem udział w procesie, rekrutując polimerazę RNA do właściwej lokalizacji.
  4. TFIIE i TFIIH - Wiązanie tych czynników transkrypcyjnych oznacza koniec formowania się przed inicjacją Wiązanie ich zwiększa efektywność tworzenia kompleksu przedinicjacyjnego.
  5. TFIIA promuje wiązanie TFIID z polem TATA.

Rysunek 01: Ogólne czynniki transkrypcji

Wyżej wymienione ogólne czynniki transkrypcyjne są specyficzne dla polimerazy RNA II, która jest rodzajem polimerazy RNA, która wydłuża nić mRNA. Istnieją ogólne czynniki transkrypcyjne związane z polimerazą RNA I i III. Ogólne czynniki transkrypcyjne mogą się również różnić w zależności od rodzaju komórki, na którą działa.

Jakie są szczególne czynniki transkrypcji?

Specyficzne czynniki transkrypcyjne to regiony, które również znajdują się w sekwencjach DNA. Są to głównie wzmacniacze lub represory. Specyficzne czynniki transkrypcyjne są specyficznymi elementami działającymi w układzie cis we wzorcowej nici DNA, które podlegają transkrypcji. Aktywacja tych specyficznych wzmacniaczy i represorów bierze udział w zwiększaniu powinowactwa enzymu poprzez zmianę orientacji cząsteczki DNA lub działanie jako regiony sygnalizacyjne. Określone czynniki transkrypcyjne są również stosowane do indukowania modyfikacji nici matrycy DNA. Modyfikacje te obejmują głównie modyfikacje kowalencyjne, takie jak metylacja. Tym samym metylowane regiony DNA działają jako specjalne wzmacniacze lub represory procesu transkrypcji.

Rysunek 02: Specyficzne czynniki transkrypcji

Konkretne czynniki transkrypcji zależą od rodzaju gatunku i nie są powszechnie spotykane u wszystkich eukariontów. Te czynniki transkrypcyjne są aktywowane przez różne warunki metaboliczne poprzez ścieżki przekazywania sygnałów. Po aktywacji regulują ekspresję genu na poziomie transkrypcyjnym.

Jakie są podobieństwa między ogólnymi a specyficznymi czynnikami transkrypcyjnymi?

  • Oba czynniki są wymagane w procesie transkrypcji.
  • Oba czynniki wpływają na ekspresję genów organizmu.
  • Oba czynniki pomagają regulować funkcję polimerazy RNA w procesie transkrypcji.
  • Oba czynniki występują głównie u eukariontów.

Jaka jest różnica między ogólnymi a specyficznymi czynnikami transkrypcyjnymi?

Transkrypcja ogólna a konkretna

Ogólne czynniki transkrypcji są czynnikami, które są stosowane do utworzenia kompleksu przedinicjacyjnego podczas procesu transkrypcji. Specyficznymi czynnikami transkrypcyjnymi są wzmacniacze lub represory, które są specyficznymi sekwencjami DNA, które aktywują lub represjonują ogólny proces transkrypcji.
 Rodzaj cząsteczki
Ogólne czynniki transkrypcyjne są oparte na białkach. Specyficznymi czynnikami transkrypcyjnymi są sekwencje nukleotydowe.
Tworzenie
Ogólne czynniki transkrypcyjne tworzą kompleks przedinicjacyjny podczas inicjacji transkrypcji. Specyficzne czynniki transkrypcyjne działają jako wzmacniacze lub represory transkrypcji.
 Rodzaje
Istnieje sześć głównych typów; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE i TFIIA ogólnych czynników transkrypcyjnych. Konkretne czynniki transkrypcyjne są głównie klasyfikowane jako wzmacniacze i represory.

Podsumowanie - ogólne a określone czynniki transkrypcji

Czynniki transkrypcji są niezbędne do regulacji transkrypcji i są wymagane do zwiększenia wydajności i dokładności procesu. Czynniki transkrypcyjne są dwoma głównymi typami; Ogólne / podstawowe i szczegółowe. Ogólne czynniki transkrypcyjne biorą udział w tworzeniu kompleksu przedinicjacyjnego podczas transkrypcji, podczas gdy specyficzne czynniki transkrypcyjne są regionami w samym DNA, które działają jako wzmacniacze lub represory. Ogólne czynniki transkrypcyjne są oparte na białkach i są wymagane przez wszystkie eukarionty. Nie jest szeroko zróżnicowany i pozostaje jako jednolite cząsteczki. Konkretny czynnik transkrypcyjny może się znacznie różnić i zależy od struktury genetycznej poszczególnych osób. Jest to różnica między ogólnymi i specyficznymi czynnikami transkrypcyjnymi.

Pobierz wersję PDF Ogólne i określone czynniki transkrypcji

Możesz pobrać wersję PDF tego artykułu i używać go do celów offline zgodnie z cytatem. Pobierz wersję PDF tutaj Różnica między ogólnymi a szczegółowymi czynnikami transkrypcyjnymi

Odniesienie:

1. Pulverr, Bernd. „Czynniki transkrypcyjne wiążące DNA specyficzne dla sekwencji”. Nature News, Nature Publishing Group. Dostępny tutaj 
2. „Czynniki transkrypcji - czynniki specyficzne dla genów różnicowo zwiększają wskaźniki transkrypcji”. DNA, Bind, Promotor i Binds - Artykuły JRank. Dostępny tutaj  
3.Orphanides, G, i in. „Ogólne czynniki transkrypcyjne polimerazy RNA II”. Genes & Development, Cold Spring Harbor Lab. Dostępny tutaj  

Zdjęcie dzięki uprzejmości:

1. „Kompleks preinicjacyjny” Autor: ArneLH - Praca własna (CC BY-SA 3.0) przez Commons Wikimedia  
2. „Rola czynnika transkrypcyjnego w regulacji ekspresji genów” Autor: Philippe Hupé - Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Computational Systems Biology of Cancer Chapman & Hall / CRC Mathematical & Computational Biology, 2012, (CC BY-SA 3.0) przez Commons Wikimedia