Różnica między Cosmidem a Fagemidem

The kluczowa różnica między Cosmid i Fagemid jest według rodzaju sekwencji, które zawiera. Kosmid zawiera stronę cos i plazmid. Dlatego jest to wektor hybrydowy, podczas gdy fagemid jest plazmidem, który zawiera replikację faga F1 pochodzącą z F1.

Kosmidy i fagemidy są wykorzystywane do klonowania, zwłaszcza do klonowania większych fragmentów DNA. Są one szeroko stosowane, zwłaszcza w klonowaniu genów odpowiedzialnych za wytwarzanie różnych białek. Kosmidy i fagemidy są albo replikowane same jako plazmidy, albo są pakowane w cząsteczki wirusa, a następnie replikowane.

ZAWARTOŚĆ

1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to jest kosmid
3. Co to jest fagemid
4. Podobieństwa między Cosmidem a Fagemidem
5. Porównanie obok siebie - Cosmid vs Fagemid w formie tabelarycznej
6. Podsumowanie

Co to jest Kosmid?

Kosmid, nazywany plazmidem hybrydowym, zawiera miejsca cos wyekstrahowane z cząstek faga Lambda i plazmidu. Te miejsca Cos to długie fragmenty DNA zawierające 200 par zasad. Dlatego mają spójne lub lepkie końce, które pozwalają plazmidowi wpasować się w wirusowe DNA. Dlatego miejsca Cos są niezbędne do pakowania DNA.

Istnieją trzy strony COS;

• strona cosN - zaangażowana w nacinanie nici DNA przez aktywność terminazy
• strona cosB - zaangażowana w utrzymywanie zakończenia.
• strona cosQ - bierze udział w zapobieganiu degradacji DNA przez DNazy.

Rysunek 01: Kosmid

Kosmidy mogą także replikować jednoniciowy DNA lub dwuniciowy DNA przy użyciu odpowiedniego miejsca startu replikacji. Kosmidy zwykle zawierają geny oporności na antybiotyki jako markery do selekcji transformantów. Zatem użycie kosmidu jako wektora może ułatwić klonowanie, a trawienie enzymu restrykcyjnego wektorze może następnie wyodrębnić te fragmenty.

Co to jest fagemid (Phasmid)?

Fagemid, zwany także jako Phasmid, jest także rodzajem wektora hybrydowego. Fagemid zawiera specjalne źródło replikacji określane jako początek replikacji f1. Początek replikacji f1 wyciąga z faga f1.

Fagemid może replikować zarówno jednoniciowy, jak i dwuniciowy DNA. Replikacja może odbywać się jako plazmid podczas niezależnej replikacji lub może zostać zapakowana w cząstki faga i ostatecznie zainfekować gospodarza bakteryjnego E coli. Podczas infekcji E coli komórek, fag f1 wymaga obecności pilusa. W związku z tym ważne są płeć płciowa in vitro pakowanie fagemidów.

Jakie są podobieństwa między Cosmidem a Fagemidem?

• Zarówno Cosmid, jak i Fagemid są wektorami do klonowania stosowanymi w technologii rekombinacji DNA.
• Cosmid i Fagemid mogą replikować jednoniciowy i dwuniciowy DNA.
• Oba mogą podlegać niezależnej replikacji podobnej do plazmidów.
• Cosmid i Fagemid mogą ulec in vitro pakowanie i infekowanie komórek bakteryjnych.
• Zarówno Cosmid, jak i Fagemid wymagają odpowiedniego źródła replikacji do klonowania.

Jaka jest różnica między Cosmidem a Fagemidem?

Cosmid vs Phagemid
Kosmid jest wektorem hybrydowym zawierającym miejsce Cos i plazmid.	Fagemid to plazmid zawierający replikację faga F1 pochodzącą z F1.
Obecność stron Cos
Miejsca Cos są obecne w kosmidach i są niezbędne do pakowania in vitro.	Witryny Cos są nieobecne w fagemidach.
Obecność źródła replikacji F1
W kosmidach źródło replikacji może, ale nie musi występować.	Początek replikacji F1 jest obecny w fagemidach.
Obecność genów opornych na antybiotyki
Geny oporne na antybiotyki są obecne w kosmidach w celu identyfikacji transformantów z nietransformantów.	Geny oporne na antybiotyki są nieobecne w fagemidach.
Wymagania dotyczące opakowań In Vitro
Wymaga strony COS.	Wymaga pilusa płciowego.

streszczenie - Cosmid vs Fagemid

Cosmid i Phagemid to wektory do klonowania stosowane w technologii rekombinacji DNA. Kosmidy to wektory hybrydowe, które zawierają specjalne lepkie końce znane jako miejsca Cos. in-vitro pakowanie wymaga tych stron COS. Podczas gdy fagemidy są plazmidami zawierającymi replikację f1 pochodzącą z faga f1. Zarówno kosmid, jak i fagemid mogą podlegać niezależnej replikacji lub in vitro pakowanie do komórek bakteryjnych. Są to ważne różnice między kosmidem a fagemidem.

Odniesienie:

1. Qi, H i in. „Wektory fagemidowe do prezentacji fagowej: właściwości, cechy i konstrukcja”. Journal of Molecular Biology., U.S. National Library of Medicine, 30 marca 2012 r. Dostępne tutaj 
2.Collins, J i B Hohn. „Kosmidy: rodzaj plazmidowego wektora klonującego gen, który można pakować w witro w głowach bakteriofagowych Lambda”. Postępowania z National Academy of Sciences of the United States of America, U.S. National Library of Medicine, wrzesień 1978. Dostępne tutaj  

Zdjęcie dzięki uprzejmości:

1.'Cosmid (angielski) 'Autor: Zlir'a (CC0) przez Commons Wikimedia