Różnica między pasmowaniem chromosomów a malowaniem chromosomów

The kluczowa różnica między pasmowaniem chromosomów a malowaniem chromosomów jest to pasmowanie chromosomów jest techniką barwienia, która wyświetla regiony chromosomów w rozróżnialnych ciemnych i jasnych pasmach, ale malowanie chromosomów jest techniką hybrydyzacji, w której określone regiony lub segmenty chromosomów są pomalowane specyficznymi dla sekwencji sondami fluorescencyjnie znakowanymi.

W cytogenetyce konieczne jest wytworzenie widocznego kariotypu organizmu w celu identyfikacji chromosomów i ich aberracji. Bandowanie chromosomów i malowanie chromosomów to dwie techniki cytogenetyczne, które pomagają w wizualizacji chromosomów. Obie techniki są przydatne w identyfikacji zaburzeń genetycznych.

ZAWARTOŚĆ

1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to jest pasmowanie chromosomów 
3. Co to jest malowanie chromosomów
4. Podobieństwa między pasmowaniem chromosomów a malowaniem chromosomów
5. Porównanie obok siebie - pasmowanie chromosomów vs malowanie chromosomów w formie tabelarycznej
6. Podsumowanie

Co to jest pasmowanie chromosomów?

Pasemka chromosomowe to technika barwienia, która wyświetla naprzemienne jasne i ciemne prążki lub regiony wzdłuż długości chromosomu. Pasmo odnosi się do części chromosomu, którą można wyraźnie odróżnić od sąsiednich segmentów, ponieważ wydaje się ciemniejsza lub jaśniejsza. W celu wytworzenia ciemnych i jasnych pasm konieczne jest wybarwienie chromosomów za pomocą odpowiedniego barwnika, takiego jak barwnik fluorescencyjny chinakryna lub barwnik Giemsa.

Istnieje kilka rodzajów technik pasmowania chromosomów. Wśród nich pasma Q, pasma wsteczne (R) i pasma G są uogólnionymi technikami pasmowania. Technika pasmowania G wykorzystuje barwnik zwany barwnikiem Giemsa i barwi obszary bogate w AT regionów heterochromatycznych w ciemno zabarwione prążki i obszary bogate w GC euchromatyczne w lekko zabarwionych pasmach. Pasmowanie R jest odwrotnością pasmowania G i barwi regiony bogate w GC w ciemnych pasmach i regiony bogate w AT w jasnych pasmach. Natomiast prążek Q wykorzystuje fluorescencyjny barwnik chinakrynę i barwi chromosomy w żółtej fluorescencji o różnej intensywności. Technika pasmowania C to kolejna technika pasmowania, która barwi regiony centromerowe. Ponadto technika pasmowania T wizualizuje regiony telomerowe.

Ryc. 01: Pasmowanie chromosomów

Wzór paskowania jest unikalny dla organizmów. Dlatego te unikalne wzory pasm są ważne w identyfikacji chromosomów i wykrywaniu aberracji chromosomowych (pękanie, utrata, duplikacja, translokacja lub segmenty odwrócone).

Co to jest malowanie chromosomów?

Malowanie chromosomowe to technika, w której określone regiony lub segmenty chromosomów są malowane za pomocą sond specyficznych dla sekwencji, które są znakowane fluorescencyjnie. Dlatego malowanie chromosomalne jest zawsze połączone z in situ Technika FISH. Jest całkowicie oparty na hybrydyzacji molekularnej z sondami specyficznymi dla sekwencji na chromosomach. Dlatego potrzebuje specyficznych sond w celu hybrydyzacji docelowych chromosomów lub regionów chromosomów.

Rycina 02: Malowanie chromosomalne

Ponadto ta technika początkowo wymaga denaturacji docelowego chromosomalnego DNA, który znajduje się w metafazie. Po drugie, etap hybrydyzacji odbywa się za pomocą sond. Gdy sondy znajdą swoje komplementarne sekwencje, hybrydyzują z określonymi regionami chromosomu. Możemy łatwo obserwować hybrydyzowane miejsca za pomocą autoradiografii lub immunofluorescencji. Przygotowanie sond, denaturacja, hybrydyzacja i wizualizacja to cztery główne etapy związane z malowaniem chromosomalnym.

Jeśli chodzi o zastosowania, malowanie chromosomalne jest przydatne przy identyfikowaniu przegrupowań chromosomalnych, punktach przerwania oraz przy określaniu materiałów pozachromosomalnych. Co więcej, jest to potężne narzędzie w dokładnej lokalizacji różnych sekwencji genów chromosomów na poziomie mikroskopowym. Ponadto malowanie chromosomalne jest pomocne w identyfikacji genów pożądanych znaków w chromosomach.

Jakie są podobieństwa między pasmowaniem chromosomów a malowaniem chromosomów?

• Pasmowanie chromosomów i malowanie chromosomów to dwie techniki stosowane w analizie cytogenetycznej.
• Obie techniki wizualizują chromosomy zwykle w metafazie.
• Te techniki mogą identyfikować normalne chromosomy i aberracje.
• Ponadto techniki te są naprawdę przydatne w identyfikowaniu zaburzeń genetycznych.

Jaka jest różnica między pasmowaniem chromosomów a malowaniem chromosomów?

Pasmowanie chromosomów jest techniką barwienia, która wyświetla części chromosomów w ciemnych i jasnych pasmach, które można odróżnić. Tymczasem malowanie chromosomów jest techniką hybrydyzacji, która maluje określone regiony chromosomów sondami specyficznymi dla sekwencji, które są znakowane fluorescencyjnie. Jest to więc kluczowa różnica między pasmowaniem chromosomów a malowaniem chromosomów. Co więcej, pasmowanie chromosomów wytwarza naprzemienne ciemne i jasne pasma wzdłuż długości chromosomu, podczas gdy malowanie chromosomów tworzy fluorescencyjnie znakowane regiony chromosomów.

Co więcej, pasmowanie chromosomów zależy od zdolności chromosomalnego DNA do barwienia barwnikiem, podczas gdy malowanie chromosomów zależy od hybrydyzacji molekularnej z sondami specyficznymi dla sekwencji na chromosomach. Jest to ważna różnica między pasmowaniem chromosomów a malowaniem chromosomów. Poza tym, w przeciwieństwie do pasmowania chromosomów, technika malowania chromosomów wymaga specyficznych dla sekwencji fluorescencyjnie znakowanych sond.

Podsumowanie - pasmowanie chromosomów a malowanie chromosomów

Pasmowanie chromosomów i malowanie chromosomów to dwie techniki wizualizacji chromosomów, zwykle w metafazie. Obie techniki pomagają zidentyfikować numeryczne i strukturalne aberracje chromosomalne i choroby genetyczne. Pasmowanie chromosomów to technika barwienia, która wyświetla określone regiony chromosomów w ciemnych i jasnych pasmach, które można odróżnić. Tymczasem malowanie chromosomalne jest rodzajem techniki hybrydyzacji, która wizualizuje określone regiony chromosomów dzięki hybrydyzacji z fluorescencyjnie znakowanymi sondami specyficznymi dla sekwencji. Jest to więc kluczowa różnica między pasmowaniem chromosomów a malowaniem chromosomów.

Odniesienie:

1. Thomas i in. „Malowanie chromosomów: użyteczna sztuka”. OUP Academic, Oxford University Press, 1 września 1998, dostępny tutaj.
2. „G Banding”. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 19 stycznia 2020 r., Dostępna tutaj.

Zdjęcie dzięki uprzejmości:

1. „Ludzki kariotyp męski NHGRI” autorstwa National Human Genome Research Institute - (domena publiczna) za pośrednictwem Commons Wikimedia
2. „Karyotyp żyrafy (Giraffa camelopardalis)” Autorzy: Anastasia I Kulemzina, Polina L. Perelman, Darya A Grafodatskaya, Trung T Nguyen, Mary Thompson, Melody E. Roelke-Parker i Alexander S. Graphodatsky - Kulemzina AI, Perelman PL, Grafodatskaya DA, i in. Porównawcze malowanie chromosomów kariotypów widłoróg (Antilocapra americana) i saoli (Pseudoryx nghetinhensis) za pomocą ludzkich i dromadycznych sond wielbłądowych. BMC Genetics. 2014; 15: 68. doi: 10.1186 / 1471-2156-15-68 (CC BY 2.0) przez Commons Wikimedia