Różnica między VNTR a sondą

The kluczowa różnica między VNTR a sondą jest to VNTR jest krótką sekwencją nukleotydową występującą jako powtórzenie tandemowe w genomie, podczas gdy sonda jest sztucznie zsyntetyzowaną krótką sekwencją DNA lub RNA, którą można znakować radioaktywnie.

VNTR oznacza tandemowe powtarzanie o zmiennej liczbie. Jest to krótka sekwencja nukleotydowa zorganizowana w powtórzeniach tandemowych w genomie. VNTR występują naturalnie w naszym genomie. Sonda to sztucznie zsyntetyzowana krótka sekwencja DNA lub RNA. Zarówno sonda, jak i VNTR są kwasami nukleinowymi lub krótkimi sekwencjami nukleotydowymi. Mają ogromne zastosowanie w różnych technikach biologii molekularnej, głównie w badaniach kryminalistycznych. VNTR i sonda mają pewne podobieństwa i różnice. Dlatego artykuł próbuje podkreślić różnicę między VNTR a sondą.

ZAWARTOŚĆ

1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to jest VNTR
3. Co to jest sonda
4. Podobieństwa między VNTR a sondą
5. Porównanie obok siebie - VNTR vs Sonda w formie tabelarycznej
6. Podsumowanie

Co to jest VNTR?

VNTR jest krótką sekwencją nukleotydową, która istnieje jako powtórzenie tandemowe w naszym genomie. VNTR są obecne w wielu chromosomach. Ponadto VNTR różnią się między poszczególnymi osobami od długości, ponieważ liczba powtórzeń jest różna w VNTR różnych osób. Zasadniczo wynika to z alleli odziedziczonych po rodzicach. Dlatego używamy głównie VNTR do identyfikacji rodziców (dziedziczenia) lub do celów osobistych. Podobnie można je również wykorzystywać w genetyce, medycynie sądowej, badaniach biologicznych i odcisków palców DNA. Dlatego VNTR jest ważnym narzędziem w biologii molekularnej.

Rysunek 01: VNTR

W dziedziczeniu analizujemy dane VNTR, stosując dwie podstawowe zasady: dopasowanie spadkowe i dopasowanie tożsamości. Podczas dopasowywania dziedziczenia osoba musi mieć allel pasujący do allelu każdego z rodziców. Podczas dopasowywania tożsamości oba allele VNTR muszą znajdować się w określonej lokalizacji genomu.

Co to jest sonda?

W kontekście biologii molekularnej sonda jest sztucznie zsyntetyzowanym fragmentem DNA lub RNA o długości od 100 do 1000 zasad. Możemy radioaktywnie oznaczyć te sondy. Dlatego używamy ich do wykrywania docelowych sekwencji nukleotydowych, które są komplementarne do sekwencji sondy. Kiedy dodajemy sondy do próbki, hybrydyzacja zachodzi z sekwencjami komplementarnymi lub sekwencjami docelowymi i ułatwia nam identyfikację sekwencji docelowych. Ponieważ sondy przenoszą radioaktywność, możemy je łatwo wykryć.

Rysunek 02: Sonda

W kryminalistyce zwykle używamy sond w technikach profilowania DNA, takich jak wykrywanie krótkich powtórzeń tandemowych, polimorfizmy długości fragmentów restrykcyjnych i pobieranie odcisków palców DNA.

Jakie są podobieństwa między VNTR a sondą?

• Kwasy nukleinowe są elementami składowymi VNTR i sondy.
• Używamy ich w procesach identyfikacji genów.
• Ponadto obie ich długości są zmienne.
• Są ważnymi narzędziami w badaniach kryminalistycznych, odcisków palców DNA, genetyki itp.

Jaka jest różnica między VNTR a sondą?

VNTR jest regionem genomu zorganizowanym jako powtórzenia tandemowe, podczas gdy sonda jest krótką sekwencją DNA lub RNA syntetyzowaną sztucznie w celu wykrycia sekwencji docelowych w próbce. Jest to więc kluczowa różnica między VNTR a sondą. Ważną różnicą między VNTR i sondą jest to, że w przeciwieństwie do VNTR, możemy radioaktywnie znakować sondy.

Co więcej, VNTR najczęściej wykonują identyfikację rodzicielską, podczas gdy sondy pomagają wykryć docelowe sekwencje nukleotydowe w próbkach DNA lub RNA, które są komplementarne do sekwencji sondy. Jest to zatem znacząca różnica między VNTR a sondą.

Poniższa infografika przedstawia więcej informacji na temat różnicy między VNTR a sondą.

Podsumowanie - VNTR vs Sonda

Powszechnym zastosowaniem VNTR i sondy są techniki analizy molekularnej, takie jak badania kryminalistyczne i pobieranie odcisków palców DNA. Oba składają się ze zmiennych długości. Jednak kluczowa różnica między VNTR i sondą polega na tym, że VNTR jest regionem genomu ułożonym z powtórzeniami tandemowymi, podczas gdy sonda jest fragmentem DNA lub RNA, który mógłby być znakowany radioaktywnie. Ponadto VNTR są obecne w genomie. Ale sondy są sztucznie syntetyzowane i mogą być znakowane radioaktywnie w celu wykrycia docelowych sekwencji nukleotydowych w próbkach DNA lub RNA, które są komplementarne do sekwencji w sondzie. Jest to zatem podsumowanie różnicy między VNTR a sondą.

Odniesienie:

1. „Zmienna liczba powtórzeń tandemowych (VNTR) i jej zastosowanie w epidemiologii bakteryjnej”. Science Alert: Journal, dostępny tutaj.
2. „Sonda DNA”. Nature News, Nature Publishing Group, dostępne tutaj.

Zdjęcie dzięki uprzejmości:

1. „D1S80Demo” Autor: PaleWhaleGail z angielskiej Wikipedii (CC BY-SA 3.0) przez Commons Wikimedia
2. „Sygnały molekularne” (CC BY-SA 3.0) przez Commons Wikimedia