Fragmenty Okazaki kontra Lagging Strand
„Fragmenty Okazaki” i „nici opóźnione” to terminy często używane w chemii. Prawdopodobnie dużo słyszałeś o okazakich fragmentach i opóźnieniu w swojej klasie chemicznej. Cóż, to tylko wtedy, gdy uważnie słuchasz swojego profesora. Ten artykuł służy jako odświeżenie tego, na czym polegają fragmenty okazaki i nici opóźnione.
Fragmenty Okazaki i nici opóźnione są omawiane, o ile chodzi o replikację DNA. Przede wszystkim replikacja DNA jest definiowana jako proces biologiczny zachodzący we wszystkich żywych organizmach i kopiujący ich DNA. Z drugiej strony DNA jest podstawą dziedziczenia biologicznego.
Podczas replikacji DNA powstają fragmenty okazaki. Te okazaki fragmenty wyglądają stosunkowo krótko. Są one uważane za produkty końcowe lub nowo zsyntetyzowane fragmenty DNA, które powstają na nici opóźnionej. Mówiąc najprościej, fragmenty okazaki powstają na opóźnionym pasmie. Nić opóźniającą definiuje się jako nić DNA, która jest replikowana w sposób nieciągły z kierunku pięciu stóp na trzy stopy. Kierunek od pięciu stóp do trzech stóp to kierunkowość w biologii molekularnej.
Fragmenty Okazaki są komplementarne do nici opóźnionej. Bez nich nie będzie powstawania krótkich, dwuniciowych odcinków DNA. Jeśli mamy określić długość fragmentów okazaki, mają one długość od 1000 do 2000 nukleotydów w Escherichia coli, rodzaj bakterii powszechnie występującej w jelitach organizmów ciepłokrwistych. Fragmenty Okazaki mierzą od 100 do 200 nukleotydów w eukariotach, organizmach o złożonej strukturze komórkowej.
Każdy z fragmentów okazaki jest oddzielony przez startery RNA. A jeśli startery RNA zostaną usunięte, enzym zwany ligazą połączy fragmenty okazaki razem w celu utworzenia nowo zsyntetyzowanej nici komplementarnej.
Jak powiedzieliśmy wcześniej, fragmenty okazaki i nici opóźniające się uzupełniają się. Istnieje jednak inna nić DNA, która odgrywa bardzo ważną rolę podczas procesu replikacji DNA. Nazywa się to nić wiodącą. Jeśli nić opóźniająca jest zdefiniowana jako nieciągła replikacja, nić wiodąca odwraca się. Jest stale replikowany. Obecność wiodącej nici umożliwia rozwijanie macierzystego dwuniciowego DNA. Mówiąc najprościej, trasa oferowana przez wiodącą część jest ciągła.
Podczas replikacji DNA pasma powinny być związane w kierunku od pięciu stóp do trzech stóp. Dzięki niezakłóconej lub ciągłej drodze wiodącego pasma nie będzie żadnych problemów. Ale jeśli chodzi o opóźnioną nić, ponieważ chodzi o przeciwrównoległy kierunek DNA, nie może być ciągła. Aby to zrekompensować, nici opóźnione są wytwarzane jako krótkie nici z komplementarną pomocą fragmentów okazaki. Jest całkiem normalne, że nici DNA biegną w przeciwnych kierunkach, ponieważ struktura DNA jest podwójną helisą. Ponieważ opóźniona nić jest w kierunku przeciwrównoległym, jej polimeraza działa poprzez powrót do widelca replikacyjnego i w krótkich odcinkach.
Fragmenty okazaki i inne powiązane procesy w procesie replikacji DNA zostały odkryte przez Kiwako Sakabe i Reiji Okazaki w 1966 roku. Przeprowadzili badania dotyczące procesu replikacji DNA bakterii Escherichia coli.
Streszczenie: